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谷子PHR 家族基因的生物信息学及表达模式分析

2021-03-18吴年隆王啸旗韩渊怀赵雄伟杨致荣

山西农业科学 2021年3期
关键词:水稻分析

吴年隆,舒 军,王啸旗,张 银,韩渊怀,赵雄伟,杨致荣

(1.山西农业大学基础部,山西太谷 030801;2.山西农业大学生命科学学院,山西太谷 030801;3.山西农业大学农学院,山西太谷 030801)

磷(P)是植物生长、发育和代谢所必需的矿质营养元素之一[1],植物主要通过根系从土壤溶液中吸收无机磷[2]。然而,磷在酸性和碱性土壤中磷易与铁、钙、铝等离子反应,生成难溶性磷[3],不利于植物吸收和同化。在农作物的农业生产中,需过量施用磷肥以弥补土壤中有效磷,但此过程会造成严重的环境污染。因此,利用分子生物学手段挖掘解析植物磷高效利用的分子机制,对磷缺乏土壤的可持续农业生产具有重要意义。

植物为了适应低磷生态环境,进化出一套复杂的基因调控网络,其中与磷酸盐吸收转运相关成员中最重要的有PHR1(Phosphate Starvation Response1)、IPS1(Induced by Phosphate Starvation1)、miR399(microRNA399)、PHO2(Phosphate2)和PT(Phosphate Transport)[4-5]。在这个复杂的调控网络中,PHR 蛋白是植物磷调控网络中的重要转录因子,在磷酸盐饥饿诱导下起着重要的信号转导调控作用[6]。目前,拟南芥、水稻、玉米等多个物种已在相应的全基因组水平上鉴定了PHR 家族基因[7-9],其中,拟南芥的AtPHR1 基因功能缺失会重塑膜脂代谢、初级代谢和次生代谢以及光合作用等,从而影响到拟南芥根冠的生长速率和花青素的积累等生理过程[10];水稻中含有MYB-CC 型结构域的基因OsPHR1、OsPHR2 和OsPHR3,其中任意一个基因功能的缺失都会抑制水稻根毛的伸长[4],进而影响植物对磷酸盐的有效吸收。

谷子(Setaria italica,2n=18)是起源于我国的一个古老作物,广泛栽培于欧亚大陆的温带和热带地区[11],具有突出的抗旱、耐瘠薄和高光效等特性,已发展为旱生C4 禾谷类模式作物[12]。……

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