基于表型性状及SNP标记的豆瓣菜种质资源遗传多样性分析
2021-03-14李双梅朱红莲柯卫东
季 群 李双梅 朱红莲 柯卫东
(武汉市农业科学院蔬菜研究所,湖北武汉 430207)
豆瓣菜(Nasturtium officinaleR.Br.,2n=2x=32)为十字花科多年生双子叶水生草本植物,在欧洲、亚洲及北美均有分布。豆瓣菜作为栽培蔬菜,在我国广东、广西、福建等地有较大面积种植,在长江中下游地区有少量种植;作为野生植物,在我国主要分布于黑龙江、山西、河北、山东、河南、四川、陕西、安徽、江苏、广东、广西、贵州、云南和西藏等地(中国科学院中国植物志编辑委员会,1987)。
国内外对于豆瓣菜亲缘关系的分类研究不多,主要是按照形态学特征和传统分子标记方法对其进行分类。Jafari 和Hassandokht(2012)利用农艺性状对伊朗的24 个野生豆瓣菜群体进行遗传多样性分析,结果将豆瓣菜分为4 组,每组具有不同的形态特征;赵博等(2007)利用79 个RAPD 引物和34 个ISSR 引物对国家种质武汉水生蔬菜资源圃的8 份豆瓣菜资源进行了亲缘关系分析,2 种分子标记均可以将8 份资源划分为3 个不同的类群。目前国家种质武汉水生蔬菜资源圃保存有19 份二倍体豆瓣菜资源,明确这19 份资源的遗传多样性和亲缘关系是将其应用于豆瓣菜育种和种质改良的基础。
基因组工具如分子标记,可以阐明种质的遗传背景,最终用于育种。传统的种质资源分类都是在形态学或农艺性状水平上,通过具有多态性的外观特征进行遗传标记。但形态性状数量少、多态性差、易受环境条件影响(Sharma et al.,2015)。RAPD分子标记最大的缺陷是不稳定、重复性差,自然可信度也较差(Gichuki et al.,2003)。尽管AFLP、SSR、ISSR 等分子标记较RAPD 具有稳定、重复性好等优点,但提供的数据量有限,不适用于大样本量的群体分析,不能完全真实反映物种的遗传多样性(Zhang et al.,2004;……
