一株产胶原蛋白酶海洋菌株的筛选及鉴定
2021-03-02郑刚王奇肖金星杨志坚陈冲赵小立
郑刚,王奇,肖金星,杨志坚,陈冲,赵小立*
(1.浙江大学舟山海洋研究中心,浙江舟山 316100;2.浙江大学生命科学学院,浙江杭州 310058)
胶原蛋白酶是能在一定的pH和温度下切割胶原蛋白主体螺旋多肽链的酶类[1];胶原蛋白降解酶指的是一类能降解天然非变性胶原蛋白的酶[2]。胶原蛋白酶是重要的商业化酶,许多细菌来源的胶原蛋白酶已被成功鉴定和表征。尽管海洋中的生物资源丰富,但是这些商业化酶中很少有海洋来源,特别是海洋细菌。本研究旨在筛选出一株产胶原蛋白酶的海洋细菌,提高水产品加工厂中废弃物的利用率。通过透明圈法筛出一株产胶原蛋白酶菌株,通过肉眼初步观察其形态学特征,随后提取其16S rRNA序列进行比对,以确定其种属来源;同时构建进化树,确定其亲缘关系。
1 材料与方法
1.1 仪器与设备
UNIVERSAL HOOD凝胶成像仪,BIO-RAD;eStain L1蛋白染色仪,金斯瑞;R 134 a冷冻离心机,Eppendorf;H1850R医用离心机、TG16-WS台式高速离心机,湖南湘仪;DW-86L386超低温冰箱,青岛海尔;YXQ-LS-50 S Ⅱ高压蒸汽灭菌锅、SPX-250B-Z生化培养箱,上海博讯;eclipse E200光学显微镜,Nikon;HS-840超净工作台,苏净安泰;UV-1800分光光度计,Shimadzu;ZQZY-88CN摇床,上海知楚;AL204电子天平、FiveEasy pH计,METTLER TOLEDO。
1.2 材料与试剂
葡萄糖(99%),琼脂粉、蛋白胨、酵母粉、Triton X-100为分析纯,购自上海生工;明胶,三氯乙酸、乙二醇甲醚为分析纯,购自阿拉丁;二水还原茚三酮,分析纯,购自源叶生物;水合茚三酮,分析纯,购自阿法埃莎公司;乙酸、乙酸钠、氯化钙等为分析纯,购自国药公司;SDS-PAGE凝胶配制试剂盒、5×非变性蛋白上样缓冲液,购自上海碧云天。
1.3 溶液制备
划线培养基:1.0%明胶、1.0%酵母粉、1.0%葡萄糖,加去离子水至1 000 mL,调节pH至7.5,115 ℃下高温灭菌20 min;……
