鉴别1家庭α地贫基因罕见突变及其家庭遗传分析
2021-02-22梁伟达曾劲伟薛家权林粤陈小龙
梁伟达 曾劲伟 薛家权 林粤 陈小龙
地中海贫血(简称地贫)是一种常染色体隐形遗传疾病,该病会导致患者血红蛋白(Hemoglobin,HB)表达异常[1]。α 地贫源于α 珠蛋白基因突变,在我国南方特别是广东广西两省携带者众多,广东人群的α 地贫基因携带率约为8.5%[2⁃3],由于其发病率高,影响大[4],目前我国把它作为一个产前筛查的常规项目。常规检测方法只能检测到常见的基因型,稀有基因型很容易漏诊[5],给产前筛查带来挑战。本研究对一个家庭中α 地贫基因一种新型罕见突变进行鉴别,并对该家庭地贫基因进行遗传分析。
1 资料与方法
1.1 资料
先证者男性,27 岁,贫血貌,患者因备孕行地贫基因分型检测,使用PCR⁃反向点杂交法(Polymerase Chain Reaction⁃Reverse Dot Blot,PCR⁃RDB)[6]基因分型检测结果为⁃⁃SEA纯合子,与血常规和血红蛋白电泳表型不符。为明确其基因型及遗传特性,同时对其父亲和母亲地贫基因进行分析。
1.2 血红蛋白电泳
采用法国CAPILLARYS 2 FLEX PIERCING全自动毛细管电泳仪进行分析,使用仪器配套的试剂严格按照标准操作规范完成实验。
1.3 PCR⁃RDB 法检测地贫基因分型
按照深圳亚能生物技术有限公司提供的试剂盒说明书进行操作。先提取DNA,然后对DNA 进行PCR 扩增,扩增条件:50℃15 min,96℃15 min,62℃50 s,72℃75 s,然后进入循环(97℃45 s,59℃50 s,72℃75 s)35 次,最后72℃延伸5 min。扩增产物滴在包被有基因突变特异性探针膜上进行杂交,观察检测膜条上各位点信号的有无,判断待检样品基因型。
1.4 α 地贫基因测序
使用Sanger 法测序,由深圳亚能生物技术有限公司提供基因测序服务。
1.5 统计与分析
地贫基因参考序列(NG_000006.1)下载自美国国立生物技术信息中心(https://www.ncbi.nlm.nih.gov/gene),使用ClustalX2 对测序结果进行序列比对及突变分析。……
