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鸡GATA 基因家族鉴定及生物信息学分析

2021-02-16李可强张传生耿立英李祥龙

河南农业科学 2021年12期
关键词:结构分析

孟 婕,王 闯,杨 晴,张 贝,李可强,张传生,耿立英,李祥龙

(河北科技师范学院 河北省特色动物种质资源挖掘与创新重点实验室,河北 秦皇岛066004)

为提高经济效益,家禽养殖中非常关注肌肉的快速生长,却忽视了心脏、肝脏等内脏器官发育缓慢的问题,这可能导致家禽免疫系统发育不良[1-3]。目前,关于禽类体质量增长及肌肉发育方面的研究较多,但是对于内脏器官的发育研究较少[4-5]。研究禽类内脏器官发育调控基因对家禽的健康养殖具有重要意义。GATA 是广泛存在于真核生物中的含锌指结构的转录因子家族,在细胞增殖和器官形成中起重要作用,其可与靶基因启动子的A/T(GATA)A/G序列特异性结合[6]。

转录因子通过识别并结合靶基因启动子的顺式元件来调控基因的表达,在生物的生长发育过程中,转录因子通过参与信号转导从而发挥关键作用。目前,GATA 转录因子家族在脊椎动物中已广泛研究,一般有6 个GATA 转录因子家族成员(GATA1—6)。脊椎动物的GATA 都有2 个高度保守的锌指结构区域(Cys-X2-Cys-X17-Cys-X2-Cys),这个区域以外的序列差异较大[7]。研究表明,GATA1、GATA2 和GATA3 主要在造血细胞系和神经系统发挥作用[8-9];GATA4、GATA5 和GATA6 主要与心脏、肺脏、泌尿生殖系统等分化有关[10-11];TRPS1可以调控下游多种基因转录,在肾脏、乳腺、卵巢等组织广泛表达[12-13]。最新研究发现,GATA1 的CF 结构域改变能够引起贫血、血小板减少和巨核细胞增生伴随轻度骨髓纤维化,从而诱发骨髓疾病[14]。

鸡是禽类性状形成分子机制、基因功能解析、基因组学与分子遗传学研究中的关键物种[15]。……

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