不同生长阶段大口黑鲈肠道微生物多样性研究
2021-02-12余凤琴陈元坤陈红霖王恕桥
但 言,余凤琴,李 双,陈元坤,陈红霖,李 燕,王恕桥
(重庆市水产科学研究所,重庆 401120)
【研究意义】肠道是鱼类重要的消化和吸收器官[1],肠道微生物存在于肠道壁、肠道黏膜及其内容物中[2],是鱼类肠道的重要组成部分,对鱼类提供屏障、促进营养吸收、提高免疫具有重要作用[1]。鱼类生长发育过程中肠道菌群结构会发生变化[3]。【前人研究进展】目前,肠道微生物的研究主要集中在不同环境[4-5]及疾病条件[6-7]下肠道微生物的差异、变化。【本研究切入点】采用高通量测序技术对大口黑鲈不同生长阶段肠道微生物结构及多样性进行分析。【拟解决的关键问题】为大口鲈肠道微生态研究、鲈养殖技术改良、益生菌筛选、疾病预防提供数据支撑。
1 材料与方法
1.1 实验动物及其养殖
实验用鱼为大口黑鲈(Micropterussalmoides),养殖在重庆市水产科学研究所长寿湖基地池塘中。实验用鱼苗均为2019年孵出,当年4月份购入并放入池塘,其间每日投饵2次(8:30、16:00),饲料为鲈鱼专用商品饲料(粗蛋白≥50%,粗脂肪≥8%,粗灰分≤16%),日投喂量为初始体重的3%~5%,并根据摄食情况随时调整。
1.2 样品采集
共采集有效样品33个,第一次采集为5月龄(2019年8月,A组),之后根据实际情况采集6月龄(2019年9月,B组),7月龄(2019年10月,C组),9月龄(2019年12月,D组),10月龄(2020年1月,E组),12月龄(2020年3月,F组),14月龄(2020年5月,G组),15月龄(2020年6月,H组),16月龄(2020年7月,I组),共采集9组,每次下午采集大口黑鲈肠道去除内容物置于5 mL冻存管中,置于-80 ℃的冰箱中保存待测。
1.3 DNA提取及16S rDNA高通量测序
样品送至深圳微生太科技有限公司,根据E.Z.N.A.®soil试剂盒说明书进行总DNA抽提;……
