MiR-181b-5p在胃癌中的表达及生物信息学分析
2021-02-06李晓晴陈雪诺
李晓晴,冯 新,陈雪诺,马 战,姜 政
(重庆医科大学附属第一医院消化内科,重庆 400016)
胃癌是世界上最常见的恶性肿瘤之一,其死亡率一直居高不下。由于缺乏肿瘤标志物和特异性的症状与体征,早期诊断以及早期治疗存在一定的困难。尽管近年来胃癌的诊断和治疗取得了很大进展,但由于肿瘤的复发和转移,胃癌患者的预后仍然较差。目前,肿瘤血清标志物如癌胚抗原(CEA)、胃蛋白酶原、幽门螺杆菌抗体以及胃镜和组织病理学检查是用于诊断和评估疾病的主要手段,但这些诊断方法对早癌的检出率较低[1]。因此,寻求可用于胃癌早期检测和大规模筛选的生物标志物显得尤为重要。
微小RNA(miRNA)是具有17~25个核苷酸的内源性非编码调节RNA,其在转录后基因调节中起重要作用[2]。由于miRNA存在于涉及肿瘤的基因组区域中,故越来越被认为是肿瘤诊断和预后的潜在生物标志物。近年来发现,miRNA在肿瘤中发挥致癌或抑癌作用。有研究发现,miR-181b-5p参与神经胶质瘤[3]、肝癌[4]、结肠癌[5]、肺癌[6]、胰腺癌[7]等多种癌症的发生与发展。然而,有关miR-181b-5p在胃癌中的表达和作用机制却罕有报道。
GEO(Gene Expression Omnibus)是由美国国立生物技术信息中心(NCBI)创建并维护的基因表达数据库,是当今最大、最全面的公共基因表达数据资源。本文通过GEO数据库的miRNA芯片数据,结合统计学和生物信息学分析方法,研究miR-181b-5p在胃癌中的表达情况,并初步探讨其可能的作用机制。
1 资料与方法
1.1一般资料:在GEO 数据库(Gene Expression Omnibus,http://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/)检索并下载胃癌的 miRNA 数据,检索词为“gastric cancer”,“microRNA”。……
