重要花卉植物高密度遗传连锁图谱构建研究进展
2021-01-22郭丽丽李昱莹郭大龙侯小改
生物技术通报 2021年1期
郭丽丽 李昱莹 郭大龙 侯小改
(河南科技大学农学院/牡丹学院,洛阳 471023)
遗传图谱(Genetic map)或连锁图谱(Linkage map)或遗传连锁图谱(Genetic linkage map),是以遗传标记间重组频率为基础的染色体或基因组内位点相对位置的线性排列图[1]。花卉植物遗传连锁图谱构建是开展分子标记辅助育种的重要工具,可将遗传图谱上的分子标记作为框架,标记和定位植物体内质量性状和数量性状基因座[2]。高密度遗传图谱是辅助基因组测序序列组装的重要工具[3],进而实现较为精细的比较基因组分析[4]。通过整合遗传图谱内种质的基因分型,可以解析基因组连锁不平衡规律,为开展全基因组关联分析[5]提供研究基础。高密度遗传图谱还可通过整合物理图谱和遗传图谱,加速主效关键基因和目标性状QTL图位克隆进程,从而有效提高育种效率和改良品种[6]。
分子标记是以核苷酸序列变异为基础,直接反应DNA水平遗传多态性的遗传标记。计算分子标记间的重组率,基于重组率构建遗传连锁图谱,特别是高密度遗传图谱,是进行遗传分析和QTL定位的重要手段,是促进种质资源性状改良的有效途径[7]。单核苷酸多态性(Single nucleotide polymorphism,SNP)是基因组水平上由单个核苷酸变异引起的DNA序列多态性,变异类型和变异频率丰富[8]。高通量测序技术的快速发展和成本的不断降低,使SNP标记在高密度遗传图谱构建研究中的应用越来越广泛[9]。
遗传图谱作为分子标记辅助育种技术的重要工具,对重要花卉植物的新品种选育具有重要的指导意义。……
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