单细胞测序技术在肝脏疾病的应用与展望
2021-01-28过冬冬孙芬贺轩昂羊东晔黄来强
生物技术通报 2021年1期
过冬冬 孙芬 贺轩昂 羊东晔 黄来强
(1. 清华大学深圳国际研究生院,深圳 518055;2. 香港大学深圳医院消化及肝脏科,深圳 518053;3. 清华大学化学系,北京 100084)
在过去的几十年里人们对疾病的研究已逐步聚焦于分子水平的改变。自从1975年英国科学家Sanger发明第一代基因测序[1]以来,基因测序已发展成人们探索细胞遗传物质变化和疾病发展的有利工具。21世纪初期,人们宣布了人类基因组计划[2]完成,这成为探索人类遗传物质的一个重要里程碑,而后人们发现器官水平的测序不能完全揭示机体变化的完整历程和潜在原因。2009年,Tang等[3]首次在Nature Methods杂志上发表从单个细胞水平上的转录组测序文章,自此打开了单细胞测序的大门。传统的“块样”大面积测序的方法得到的结果可能是由于多个细胞“平均”后的宏观结果,掩盖了单个细胞之间存在的差异,致使人们在研究相关疾病的时候往往聚焦在“面”上,而单细胞测序技术的出现使得人们能够看到具体的“点”。
肝脏作为人体中心免疫器官、血流丰富器官和再生能力超强的器官,具有复杂的细胞组成与分化程度不同的细胞阶段。近年来研究表明,肝脏疾病的发生很大程度上是肝实质细胞自身遗传物质、所处的微环境与外来影响因子(如病毒)共同作用的结果[4-5]。然而有关肝脏疾病的透彻认识与精准治疗却十分有限,原因之一在于传统疾病分析方法往往不够精准且具有一定局限性。单细胞测序技术的出现对揭示肝脏疾病内在发生机制有重要意义,它使得人们能够从分子水平了解肝脏功能和肝脏有关疾病的生理与病理意义。……
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