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猪蛔虫全基因组微卫星分子记开发与特征分析

2021-01-21何晶晶黄建华牛红艳周春花吴小平

中国兽医杂志 2020年9期

何晶晶,黄建华,牛红艳,周春花,吴小平

(南昌大学生命科学学院,江西 南昌 330031)

猪蛔虫(AscarissuumGoeze,1782年)隶属于线虫纲蛔虫目,主要寄生于猪小肠,是生猪感染的最常见寄生虫之一,给养猪业造成巨大的经济损失[1]。同时猪蛔虫也可以感染人,危害人类健康[2]。因此,许多国家已将其纳入公共卫生学范畴[3]。微卫星标记又称短串联重复序列(Simple tandem repeat,STR),广泛分布于原核和真核生物基因组中,由1~6 bp的重复单元串联而成,以双核苷酸重复最为常见[4]。与其他分子标记相比,微卫星分子标记因其存在广泛、数量多、分布均匀、多态性信息丰富、遗传共显性、具有较好的稳定性和重复性、易于检测等优点,成为目前遗传多样性和遗传结构研究中的首选标记之一[5]。但目前没有关于猪蛔虫的微卫星分子标记相关信息的报导。虽然有学者应用微卫星标记研究猪蛔虫,但这些标记都是基于其近缘种人蛔虫而开发[6-8]。近年来随着测序技术的发展,从全基因组水平研究物种的微卫星,一方面可以了解不同物种微卫星的生物信息学特征,另一方面可以揭示微卫星在遗传多样性等领域的应用[9-10]。因此,近年来基于全基因组开发微卫星分子标记受到研究者青睐。猪蛔虫全基因组测序已完成,其基因组微卫星分布规律也有报道[11-12]。本试验基于已公布的猪蛔虫全基因组数据,设计微卫星引物,验证其多态性,并进一步检测其在近缘种人蛔虫中的扩增情况,以期为猪蛔虫和人蛔虫的种群遗传研究、流行病学、宿主特异性、遗传结构、交配模式提供有价值的研究工具和分子标记资源。……

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