APP下载

基于网络药理学的刺五加总苷抗疲劳作用机制研究

2021-01-19张宇航邱智东傅超美綦晓娜贾艾玲

中草药 2021年2期
关键词:数据库

高 寒,徐 伟*,张宇航,邱智东,傅超美,綦晓娜,贾艾玲, *

• 药理与临床 •

基于网络药理学的刺五加总苷抗疲劳作用机制研究

高 寒1,徐 伟1*,张宇航1,邱智东1,傅超美2,綦晓娜3,贾艾玲1, 2*

1. 长春中医药大学药学院 中药有效成分省部共建教育部重点实验室,吉林 长春 130117 2. 成都中医药大学药学院,四川 成都 611137 3. 北华大学附属医院 妇产科,吉林 吉林 132000

基于网络药理学方法探究刺五加总苷抗疲劳的潜在作用机制。以刺五加总苷中7种主要活性成分为研究对象,利用Swiss Target Prediction网络平台预测其作用靶点;通过GeneCards、OMIM、DiGseE数据库获取与疲劳有关的靶标,借助Cytoscape 3.7.2软件构建“活性成分-抗疲劳靶点”网络图,并通过度值筛选核心成分;使用String平台进行蛋白质-蛋白质相互作用(protein-protein interaction,PPI)分析,结合Cytoscape 3.7.2软件构建PPI网络图,通过度值、节点紧密度、节点介度筛选关键靶点,并利用DisGeNET数据库对靶点的类型进行归属;使用AutoDock vina软件对核心成分与关键靶点进行分子对接;采用DAVID数据库对刺五加总苷抗疲劳的作用靶点进行基因本体(gene ontology,GO)富集分析和京都基因与基因组百科全书(Kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)通路富集分析。获得刺五加总苷中7种主要活性成分包括刺五加苷A、刺五加苷B、刺五加苷B1、刺五加苷C、刺五加苷D、刺五加苷E和芝麻素,预测得到抗疲劳靶点83个,筛选出核心成分3个,包括刺五加苷B、刺五加苷B1、刺五加苷C,关键靶点4个,包括热休克蛋白90α家族A级成员1(heat shock protein 90 α family class A member 1,HSP90AA1)、信号传导及转录激活因子3(signal transducer and activator of transcription 3,STAT3)、血管内皮生长因子A(vascular endothelial growth factor A,VEGFA)、基质金属蛋白酶9(matrix metalloproteinase 9,MMP9);分子对接结果显示,核心成分与关键靶点的结合能力与三磷酸腺苷二钠(ATP-2Na)相近;……

登录APP查看全文

猜你喜欢

数据库
数据库
数据库
数据库
数据库
数据库
数据库
数据库
数据库
数据库
数据库