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基于全外显子测序技术分析胰腺导管癌体细胞突变与患者临床特征的关系

2021-01-13宋瑶琳纪彬彬刘相兰杨平王博梁乐彬王爱兰杨家亮田埂邢晓明

精准医学杂志 2020年6期
关键词:基因突变分析研究

宋瑶琳 纪彬彬 刘相兰 杨平 王博 梁乐彬 王爱兰 杨家亮 田埂 邢晓明

(1 青岛大学附属医院病理科,山东 青岛 266021; 2 元码基因科技(北京)股份有限公司; 3 烟台毓璜顶医院病理科)

胰腺癌是高度致死性的恶性肿瘤之一,死亡率居全球第四。大多数胰腺癌患者确诊时已无法通过手术切除病灶,治疗的中位生存期仅6~9个月,5年生存率低于5%,而行手术治疗后患者的生存率也不足25%。因此,胰腺癌的诊疗是目前面临的主要挑战之一[1-2]。尽管全球范围内已针对胰腺癌进行了数十年的基础和临床转化研究,但仅有极少数新疗法进入了临床批准阶段[3]。胰腺癌患者的不良预后主要归因于胰腺癌细胞的快速转移,因此了解胰腺癌细胞转移的遗传分子机制,对于进行有效的靶向治疗至关重要。

近年来,下一代测序技术在胰腺癌发生发展分子机制的研究中广泛应用[4],在揭示胰腺癌的遗传基础、基因突变和发现新的驱动基因方面发挥了重要作用。识别胰腺癌体细胞突变和临床特征之间的相关性,发现新的肿瘤基因组生物标记物,有利于对患者进行更加精准治疗[5-6]。本研究应用胰腺导管癌(PDAC)患者的肿瘤组织进行外显子组测序,并应用COSMIC数据库验证体细胞单核苷酸多态性(SNP)位点,评估依靠单样本测序数据识别致癌体细胞突变的可行性;同时,分析鉴定致癌体细胞突变与患者临床病理特征之间的相关性。

1 材料与方法

1.1 样本收集与外显子组测序

收集2009—2011年在青岛大学附属医院行手术切除的PDAC患者的肿瘤组织样本40例,患者术前均未接受过放疗以及化疗治疗。……

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