通过miRNA基因表达谱的基因共表达网络构建对星形细胞瘤的基因靶标进行预测
2021-01-12邵嘉敏
生物信息学 2020年4期
关键词:差异
邵嘉敏
(石门县人民医院 神经外科,湖南,常德 415000)
星形细胞瘤是指以星形胶质细胞所形成的肿瘤,占颅内肿瘤的13%~26%,占胶质瘤21.2%~51.6%,男性多于女性。星形细胞肿瘤可发生在中枢神经系统的任何部位,一般成年多见于大脑半球和丘脑底节区,儿童多见于幕下。星形细胞瘤为浸润性生长肿瘤,多数肿瘤切除后有复发可能,且复发后肿瘤可演变成间变性星形细胞瘤或多形性胶质母细胞瘤[1]。由于其生长缓慢,出现症状通常是隐性的,例如颅内压升高而引起的神经系统变化和不适的能力。小脑肿瘤的常见症状包括共济失调,颅神经缺损和颅内压升高的迹象(如头痛,恶心和呕吐)。当存在于视觉通路中时,肿瘤可能会导致视力丧失或视野缺损,并且当定位于下丘脑时,可能导致内分泌综合征,例如尿崩症,性早熟或电解质失衡。因此寻找其生物标志物早期诊断,并研究新的治疗方法就十分重要。
miRNA在多种癌症中存在差异性表达,相对于正常组织的对应调节物,大多数miRNA在癌症中被抑制[2-4]。通过敲低miRNA加工机制来分解miRNA可以刺激体内细胞转化和肿瘤发生[5]。这意味着miRNA表达的改变甚至可能是肿瘤发生后导致的,而且仍然还积极地促进了癌症的发展。尽管miRNA在癌症中普遍减少,但还有一些miRNA上调,其中某些可以发挥致癌作用。有研究认为白细胞中的总体miRNA水平也可能影响甲基化失调的相关癌症发展过程[6-7]。鉴于miRNA通过调节靶mRNA发挥其功能,因此预测miRNA靶标非常重要。……
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