储昭阳，朱向明，江峰，刘表虎，李国杰，龚儒杰，马平川，徐凯慧

(1. 皖南医学院研究生院，安徽 芜湖 241000；2. 皖南医学院弋矶山医院超声医学科，安徽 芜湖 241000；3. 浙江省台州市黄岩区妇幼保健院超声医学科，浙江 台州 318020)

肾细胞癌(renal cell carcinoma，RCC)起源于肾上皮，是最常见的肾癌类型[1]，预后差[2]。RCC约占肾癌的90%，其中最常见的组织亚型是肾透明细胞癌(kidney renal clear cell carcinoma，KIRC)[3]。目前根治性切除是KIRC的主要治疗方法，其次是放疗、化疗和靶向治疗，然而，即使在成功的治疗后，30%的患者出现肿瘤复发或远处转移[4]，因此，探讨KIRC的发生机制和治疗方法已迫在眉睫。肿瘤微环境(tumor microenvironment，TME)的结构成分主要是基质细胞和免疫细胞[5]。本研究应用ESTIMATE和CIBERSORT计算方法[6]，计算了来自癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas，TCGA)数据库的KIRC样本的TICs比例和TME中免疫和基质成分的比率，并确定了一个预测性生物标志物：过氧化物酶体增殖物激活受体γ共激活因子-1A(PPARGC1A)。最近的一项研究也发现，PPARGC1A缺乏会引起自发性肾脏炎症并增加急性肾损伤(AKI)的严重性[7]。本文从KIRC免疫成分和基质成分比较产生的差异表达基因(DEGs)出发，通过一系列分析揭示PPARGC1A可能是KIRC中TME状态改变的潜在指标。

1 材料和方法

1.1 数据准备并进行评分 从TCGA数据库(https：//portal.gdc.cancer.gov/)下载611例KIRC病例的转录组RNA-seq数据(正常样本72例；肿瘤样本539例)和相应的临床数据(年龄、性别、肿瘤分级、病理分期和生存结果)，利用LIMMA软件包进行归一化处理，删除正常或重复的样本[8]。之后使用R语言4.0.2版本，加载ESTEST软件包[9]，对每个样本的TME中免疫、基质成分的比例进行估计，分别表现为免疫评分、基质评分和总评分三种评分形式，它们分别与免疫、基质和两者的总和的比率正相关，这意味着各自的分数越高，在TME的相应成分的比率越大。……