利用分子对接技术筛查解热消炎胶囊抗病毒及消炎成分的研究

2021-01-11陈沛洪黄丹梅柯少芳庄起明肖辉炎谢成松陈一村

汕头大学医学院学报 2020年4期

陈沛洪，黄丹梅，柯少芳，庄起明，肖辉炎，谢成松，陈一村

(1.汕头大学医学院第二附属医院，广东汕头 515000；2.汕头大学医学院药理学教研室，广东汕头 515000；3.广东太安堂药业股份有限公司，广东汕头 515000)

新型冠状病毒肺炎目前尚无特效药，亦无相应的抗体中和。在此次抗疫中，中药汤方及中成药在治疗新冠肺炎过程中起到一定的作用，如连花清瘟颗粒等。解热消炎胶囊(广东太安堂药业股份有限公司)为临床治疗呼吸道感染引起的发热、咽喉肿痛、扁桃腺炎、咽炎等症的中成药，产品处方源自古代防治瘟疫病的经典方——安宫牛黄丸，以水牛角、板蓝根、金银花、珍珠母粉、广藿香、石菖蒲等中药为原料，采用中药提取物进行组方，具有清热解毒、镇惊安神功效。分子对接筛选技术作为计算机辅助药物设计和高通量筛选的一种重要方法[1]，是在现有生物结构的基础上发现新配体的技术，分子对接筛选过程极大地缩小了人工方法进行配体活性筛选的研究范围及时间[2]。据报道此次新型冠状病毒与细胞的作用方式和2003年的冠状病毒相似，均通过与人细胞的血管紧张素转换酶2(angiotensin converting enzyme 2，ACE2)作用进入细胞[3]。故本研究通过分子对接技术，探讨解热消炎胶囊的有效成分与新型冠状病毒的受体ACE2以及引起炎症的受体环氧合酶2(cyclooxygenase-2，COX-2)及其下游信号蛋白花生四烯酸酯15-脂氧合酶(arachidonate 15-lipoxygenase，ALOX15)的亲和作用。

1 材料与方法

1.1 数据库与软件

TCMSP数据库(http://tcmspw.com/tcmsp.php)；STRING数据库11.0(https://string-db.org)；PDB数据库(https://www.rcsb.org)；AutoDockTools 1.5.6(http://autodock.scripps.edu/resources/adt)；AutoDock Vina 1.1.2(http://vina.scripps.edu)；PyMOL 1.7(http://pymol.org)。