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马铃薯S病毒RT-qPCR通用检测体系的建立与应用

2021-01-08程胜群吕文河高艳玲白艳菊范国权邱彩玲董学志白雅梅

华北农学报 2020年6期
关键词:检测

程胜群,吕文河,高艳玲,,白艳菊,范国权,张 威,张 抒,邱彩玲,申 宇,董学志,白雅梅

(1.东北农业大学 农学院,黑龙江 哈尔滨 150030;2.黑龙江省农业科学院 马铃薯研究所,黑龙江 哈尔滨 150086;3.东北农业大学 资源与环境学院,黑龙江 哈尔滨 150030)

作为中国第四大粮食作物,马铃薯产量高、营养丰富,在确保粮食安全方面具有重要作用[1]。预计到2020年马铃薯种植面积可以扩大到667万 hm2[2]。但由于病毒病的危害,导致产量和品质下降。侵染马铃薯的病毒大约有40种[3],马铃薯S病毒(PotatovirusS, PVS)是影响全球马铃薯生产仅次于马铃薯Y病毒(PotatovirusY, PVY)和马铃薯卷叶病毒(Potatoleafrollvirus, PLRV)的第三大病毒[4]。2004-2009年,PVS在中国马铃薯主产区大田种薯的检出率为0.32%~19.80%,仅次于PVY[5-8],带毒率由北向南呈增高趋势[9]。

PVS属于乙型线形病毒科(Betaflexviridae)香石竹潜隐病毒属(Carlavirus)[10],是长610~710 nm的弯曲线状粒子,正单链RNA(+ssRNA)长8.4~8.5 kb[11]。PVS于1948年在荷兰首次发现[12],遗传进化分析表明,PVS起源于南美,后被引入欧洲并扩展为主要传播中心[13],目前广泛分布于美国、英国、荷兰、伊朗等马铃薯产区[14]。根据PVS侵染昆诺瓦藜(Chenopodiumquinoa)的症状可将其分为PVSO(Ordinary strain)和PVSA(Andean strain)株系[9],其中,PVSO侵染后昆诺瓦藜表现局部枯斑,而PVSA株系则表现为系统侵染。Cox等[15]发现并建议将昆诺瓦藜表现系统侵染但与PVSO遗传关系较近的分离株命名为PVSO-CS(CS=Chenopodiumsystemic)。并建议将来使用PVSA-CL(CL=Chenopodiumlocalized)代表不能系统侵染昆诺瓦藜但与PVSA遗传关系较近的分离株。2018年,欧洲发现5个PVS重组分离株,其中1个为PVSA-CL[16]。此外,PVS分离株RVC在全序列遗传进化树中既不属于PVSO,又不属于PVSA,可能代表了一种新的PVS株系[11]。目前,PVSO和PVSA在中国内蒙古、黑龙江、辽宁、河北、山东、青海、广西、湖南、四川、浙江、福建、贵州等地均有报道[17]。……

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