环状RNA:银屑病研究治疗的新希望
2021-01-06王亚杰陈雪严炯王峥嵘刘青赵珩魏跃钢施建新通信作者
王亚杰,陈雪,严炯,王峥嵘,刘青,赵珩,魏跃钢,施建新(通信作者*)
(1.南京中医药大学附属医院,江苏 南京 210029;2.东部战区总医院,江苏 南京 210002)
1 环状RNA的背景
最初发现circRNA是在植物类病毒、酵母线粒体及乙型肝炎病毒中[1],但是由于结构特殊(结构中不存在5′帽子结构或3′聚(A)尾巴结构),当时的RNA测序技术及生物信息分析技术有限,环状RNA一直被认为是异常剪切后错误拼接的副产物[2]。伴随着高通量RNA测序(RNA-seq)技术和生物信息学分析的快速发展,在人组织中已经检测出数以万计的circRNA[3],因此在很多研究领域中,科学家们都发现其参与了多种疾病的发生及发展。
2 环状RNA的类型及成环机制
circRNA根据来源可以分为四类:全外显子型的circRNA、内含子和外显子组合的EIcircRNA、内含子组成的套索型circRNA、由病毒RNA基因tRNA、rRNA、snRNA等环化产生的circRNA。不过就目前的情况来说,circRNA的成环机制有四种主流推测。第一种是依赖于剪切体进行的索尾接环化,第二种是RNA结合蛋白(RBPs)调控的环化。第三种是内含子逆转互补配对驱动的环化。第四种是前体基因剪接中内含子去除或外环子的套索环化[4]。
3 环状RNA的特点
circRNA大多数是由外显子环化而成的,外显子circRNA主要细胞质或储存于外泌体中,而较少部分内含子和外显子组合的EIcircRNA和内含子circRNA则大多数存在于细胞核中[5]。目前研究表明circRNA有以下特点:(1)高稳定性:circRNA的结构中没有5′帽子结构或3′聚(A)尾巴结构,可抵抗RNA核酸外切酶或RNaseR降解,相比传统的线性RNA稳定性更高。(2)高特异性:主要体现在细胞类型特异性及发育不同阶段的组织特异性。……
