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基于液相色谱-质谱联用的代谢组学技术研究Pokemon诱导的胞内脂代谢变化

2020-12-25金一宝李上富刘红霞蒋宇扬王铁杰

色谱 2020年2期
关键词:水平

金一宝,李上富,王 珏,高 丹,刘红霞,蒋宇扬,殷 果,王铁杰*

(1.深圳市药品检验研究院,深圳市药品质量标准研究重点实验室,广东 深圳 518057;2.清华大学深圳研究生院,广东 深圳 518055)

Pokemon蛋白是由染色体19p13.3区带ZBTB7A基因编码的产物,作为一种转录抑制因子,能够通过影响染色质的重组或直接与抑癌基因结合而抑制抑癌基因的转录,从而促使肿瘤形成[1,2]。2005年美国癌症研究中心[3]提出Pokemon的调控机制可能是通过Pokemon-ARF(alternative reading frame)-MDM2(murine double minute2)-P53细胞信号传导通路。Zu等[4]绘制了Pokemon介导的基因调控网络,发现Pokemon的调控作用主要分布在代谢、基因转录调控和细胞信号转导等生命活动中,其中有74个基因与机体代谢有关,涉及44条代谢途径。但Pokemon在肿瘤基因调控代谢网络中所起作用还不是十分清晰,需要进一步的研究。

代谢组学是近年来新的研究技术手段,是继基因组学、转录组学、蛋白质组学后系统生物学的另一重要研究领域,主要研究生命体在受外界或自身改变的情况下小分子代谢物的变化[5,6]。代谢物处于基因组和蛋白质组的下游,通过研究代谢物的变化,反推基因和酶的调控过程。代谢组学作为一种新的组学方法在疾病机制研究方面具有广阔的应用前景[7]。目前,代谢组学已在肿瘤发病机理、肿瘤标志物鉴定、疾病诊断、动物模型、药物毒性和机理研究、基因功能的阐明等方面取得了突破和进展[8-12]。

本文利用代谢组学技术,比较了肝细胞HL7702瞬时转染Pokemon基因所获得的高表达细胞与对照组细胞的代谢途径和代谢物质的变化,获得了Pokemon介导的肝癌细胞代谢差异,探讨肝细胞中Pokemon引发的小分子代谢物、酶和调控基因之间的相互关系,研究Pokemon作为原癌基因在肝癌发生发展中的作用机制和功能。……

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