利用cBioPortal分析P53在肌层浸润型膀胱癌中的表达、突变及临床意义
2020-12-21梁维朝高伟伟
临床医药文献杂志(电子版) 2020年83期
关键词:分析
梁维朝,高伟伟*
(桂平市人民医院肿瘤科,广西 贵港 537200)
膀胱癌的发病率越来越高,是男性第四种常见的癌种,严重危害人类的健康[1]。膀胱癌发生机制与基因突变及新生血管形成密切相关。p53突变在尿路上皮肿瘤最常见的遗传事件。p53是一种充分表征的肿瘤抑制基因, p53突变与肿瘤进展和预后有关[2]。本研究应用TCGA数据库提供的数据分析p53在肌层浸润型膀胱癌中的表达、突变及临床意义。
1 资料与方法
1.1 数据材料收集
从http://www.cBioPortal.org/中下载413例 TCGA 数据库提供的肌层浸润型膀胱癌临床资料数据及p53 RNASeq V2的数据,进行分析。
1.2 数据集筛选与临床参数资料相关研究
将标本样品的ID号将病人信息整合成EXCEL表格,删除缺失或部分资料缺失的数据,按照p53表达值从高到底排列,取中位数为截点,分低表达组206例,高表达组201例,分析p53的表达与临床之间的相关性。
1.3 统计学处理方法
使用SPSS 22.0处理数据。计数资料以率(%)表示,比较采用x2检验,以P<0.05表示有统计学意义。采用Spearman相关分析p53基因表达与相关因素之间关系等。将有统计学意义的指标纳入cox模型行多因素分析。
2 结 果
2.1 突变情况
413例肌层浸润型膀胱癌患者,P53突变比率50%(207/413);在207例p53基因突变病例中,错义突变占77.8%(161/207),截短突变32.9%(68/207),错义突变+截短突变22例,框移突变1例。
2.2 p53的表达与临床病理资料及突变的相关性
p53的表达与 AJCC P TNM分期、肿瘤远处转移、淋巴结转移,临床分期在Spearman相关分析中呈负相关(P<0.05),而与肿瘤淋巴管浸润和病理分级呈正相关(P<0.05),p53的表达与突变无相关性。t检验得出,P53按膀胱癌肿……
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