肿瘤相关巨噬细胞与长链非编码RNA在肿瘤发展中的研究进展*
2020-11-23葛将李文坤李倩王芸王亚丹综述吴静审校
葛将 李文坤 李倩 王芸 王亚丹 综述 吴静② 审校
1 长链非编码RNA
2003年人类基因组测序完成后,发现仅有20 000个基因参与蛋白质编码,然而超过98%的基因不进行蛋白质翻译,称为非编码RNA(non-coding RNAs,ncRNAs)[1]。传统意义上的ncRNAs分为两大类。第一大类根据长度的不同分为:长度<200个核苷酸的短链非编码RNA,如microRNA(miRNA)、转运RNA(tRNA);长度超过200个核苷酸达到10万个碱基对的长链非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA)。第二大类组成包括:在X染色体失活中发挥重要作用的X染色体失活特异转录物(X-inactive-specific transcript,Xist)、同源框基因反义基因间RNA(homeobox gene antisense intergenic RNA,HOTAIR)、H19[2]。
1.1 lncRNA分类和结构
lncRNA构成了非编码基因组大部分空间,根据其在基因组上相对于蛋白质编码基因的位置,lncRNA分类为正义lncRNA、反义lncRNA、双向lncRNA、基因间lncRNA、内含子lncRNA。这些非编码转录本通常与相应的mRNA编码序列存在部分重叠,可能具有mRNA相同的功能。lncRNA包括一类不同转录本,其结构类似于mRNA,但不编码蛋白质[3]。与mRNA相同,大多数lncRNA也是由RNA聚合酶Ⅱ转录,进行可选择性剪切,可能携带有单核苷酸多态性(SNPs),进行5’端加帽和聚腺苷酸化[4]。结构上,lncRNA可以形成复杂二级结构及复杂高级结构,增强识别蛋白质的能力[5]。
1.2 lncRNA调控机制
lncRNA在转录和转录后水平调控基因表达[6]。在转录水平,lncRNA通过顺式或者反式作用以与染色质修饰酶相互作用、诱捕转录因子和直接与启动子结合等方式导致基因的激活或沉默[7-9]。lncRNA LNAPPCC与EZH2结合,抑制EZH2与PCDH7启动子结合,下调PCDH7启动子中组蛋白H3K27me3水平,激活PCDH7的表达[10]。lncRNA HAND2-AS1将转录因子E2F4募集到C16orf74启动子区域,并下调C16orf74表达。有报道表明,HAND2-AS1通过募集转录因子E2F4抑制C16orf74表达而抑制宫颈癌发生发展[11]。……
