早在红楼时期，北京大学就开办了小型的托儿所;1952年，北京大学迁入燕京大学的校址，在此校址上正式成立“北京大学附设幼儿园”;1995年，北京大学幼儿园更名为“北京大学幼教中心”;2014年，幼儿园再次更名为“北京大学附属幼儿园”;自2018年开始，幼儿园成为北京大学独立的二级单位，由北京大学教务处管理。

幼儿园目前包括燕东、蔚秀两个分园，共33个教学班，在园幼儿1000余名。幼儿园为北京市一级一类（双一园）市级示范幼儿园、北京市0-3岁社区早教示范基地、北京市残障儿童随班就读资源研究中心、北京市儿童保健工作示范园等，幼儿园食堂为北京市A級标准食堂、北京市海淀区食药局量化分级评定A3等级食堂。

基于蔡元培先生“深知儿童身心发达之程序，而择种种适当之方法以助之”的教育主张，幼儿园融合了多个专业学科，包括学前教育、发展心理、特殊教育、音乐、体育等，并将这些专业统一整合起来，为儿童的全面发展提供支持，也为家长育儿提供帮助。

幼儿园全体教职工秉承“勤奋、严谨、求实、创新”的北大传统，重视对儿童教育的研究与探索，充分利用高校丰富的人文和自然科技教育资源，在幼儿园内成立儿童心理评估咨询室和教科研室，开展儿童心理发展与幼儿教育的研究，力求为儿童的发展提供更加适宜的个性化支持。

幼儿园实施全纳融合教育，关注包括特殊儿童在内的每一位儿童的发展和需要，践行“尚自然、展个性、促融合、共发展”的核心教育理念;弘扬北京大学人文精神，汲取全纳教育思想精髓，为所有在园儿童的发展提供个性化支持;物化儿童教育的生态观，奠定儿童与自然、与社会、与同伴、与自身互补共生、交叉融合、终身发展的基础;秉持“人人是教育对象、时时是教育良机、事事是教育题材、处处是教育场所”的理念，构筑家、园、社区三方立体教育模式。

基于这样的历史背景和发展现状，北京大学附属幼儿园将自身发展定位为“研究型幼儿园”，并成立研发室，在各项工作内容和环节当中，践行重视研究、开展研究、应用研究，将“研究”的科学态度、实施办法、评估评价在园内进行全覆盖无缝式渗透和推进，努力实现园所发展史上里程碑式的尝试和飞跃。