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转运RNA中1-methyguanosine修饰核苷研究进展

2020-08-19涛,雪,

生物学杂志 2020年4期
关键词:结构

张 涛, 刘 雪, 陈 鹏

(华中农业大学 植物科学技术学院, 武汉 430070)

tRNA是翻译过程中的核心分子,对遗传信息的正确解读起至关重要的作用。tRNA具有高度保守的二级结构和三级结构,而且具有大量由4种基础核苷——U、C、G、A衍化而来的修饰核苷。 这些核苷修饰既可以微妙的方式改变tRNA的局部构型,也可以大范围重组的方式改变tRNA的整体结构[1]。有研究表明,某些修饰的存在可以增加tRNA结构的稳定性,诱导tRNA的正确折叠[2]。

在所有tRNA核苷修饰类型中,甲基化是最常见的修饰。甲基化几乎发生在碱基的所有含氮位置上,此外,核糖的2′-羟基的氧原子、嘧啶第5位C原子、腺苷的第2和第8位的C原子上均可发生甲基化[3]。这些核苷甲基化修饰是由多种甲基转移酶(Methyltransferase, 或MTase)催化的。目前被鉴定的RNA MTase包括60多个成员,数百个同源蛋白,归为4个超家族:1)Rossmann-fold 甲基转移酶(简称RFM)[4];2)SpoU-TRMD 甲基转移酶(简称SPOUT 甲基转移酶)[5];3)Radical-SAM甲基转移酶[6];4)FAD/NAD(p)-结合蛋白[7]。

tRNA甲基转移酶是甲基转移酶中的一种,其命名方式是在Trm或TRMT后加数字或字母。本文综述了负责tRNA上9位和37位鸟嘌呤N1甲基化的甲基转移酶,探讨不同的酶针对不同底物位点的特异性识别机制。

1 tRNA中的m1G修饰

tRNA分子上普遍存在着修饰核苷,很多转录后修饰有助于tRNA的正确折叠,而不同位置及不同类型的修饰可以影响tRNA分子的局部结构、整体稳定性、酶学动力学及最终翻译过程的解码能力[8]。其中,反密码子茎环附近的修饰会直接影响蛋白质翻译过程的效率和准确性[9-10]。

N1-methylguanosine(m1G)是由特定的甲基转移酶特异性识别tRNA鸟嘌呤(G)第一位N原子,以S-腺苷甲硫氨酸(S-adenosyl-methionine,AdoMet/ SAM)为甲基供体,在识别位点添加一个甲基基团而形成(图1-A)。……

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