杀鱼爱德华氏菌非编码小RNA sR082的功能研究
2020-08-19周海珍李墨非
周海珍 , 李墨非
(1.中国科学院海洋研究所 实验海洋生物学重点实验室, 青岛 266071; 2. 中国科学院大学 地球科学学院, 北京 100049)
杀鱼爱德华氏菌(Edwardsiellapiscicida),原名迟缓爱德华氏菌(Edwardsiellatarda)是一种革兰氏阴性病原菌,可感染鱼类、爬行动物、鸟类和人类[1]。由杀鱼爱德华氏菌引发的爱德华氏菌病给我国多种重要经济鱼类养殖,如牙鲆、大菱鲆、鳗鲡和真鲷等造成了巨大的经济损失[2]。近年来,对于杀鱼爱德华氏菌致病机制的研究取得了一系列进展,已发现多种毒力系统和致病因子,如,Ⅲ型分泌系统(T3SS)[3]、Ⅵ型分泌系统(T6SS)[4]、群体感应系统[5]等。这些毒力因子在杀鱼爱德华氏菌黏附、侵染及在宿主细胞中存活起着重要的作用[6]。但是目前我们对杀鱼爱德华氏菌的感染机制,包括在宿主细胞内的生存与复制机制等,仍不清楚。
细菌sRNA长度约为50~500 nt,能转录但不能翻译,通过碱基配对的方式调控靶基因mRNA的翻译及稳定性[7]。近年来研究发现细菌非编码小RNA(Small non-coding RNA,sRNA)作为一种调控因子在转录后水平调节基因表达,参与调控细菌环境应答、生物膜形成、运动性和致病性等生物学过程[8-9]。在爱德华氏菌的研究中,Sun等[10]通过RNA测序和qRT-PCR法鉴定了E.tardaS08的10个sRNA (ET_sRNA_1至ET_sRNA_10)。TargetRNA2靶基因预测结果表明这10个sRNA的靶基因均直接或间接与毒力相关,说明它们可能参与调控迟缓爱德华氏菌的毒力[10]。
本实验室前期研究发现杀鱼爱德华氏菌TXD1在不同生长环境(正常LB培养、酸性胁迫、缺铁胁迫和氧化胁迫)下共有148个sRNA表达。相比正常LB培养组,共有103个sRNA在3种胁迫环境下有显著差异表达。……
