王一亭 李 波 王厚红 吴法龙 张 磊

(1.中国科学院水生生物研究所中国科学院水生生物多样性与保护重点实验室，武汉 430072;2.中国科学院水生生物研究所淮安研究中心，淮安 223002;3.武汉市农业科学院，武汉 430207;4.淮安市洪泽区三河镇农业技术服务站，淮安 223124)

微生物群落是养殖生态系统的重要组成部分[1],其在一定程度上决定养殖生态系统的稳定性[2],并能够较好地指示养殖环境健康状况[3],因此,通过养殖环境微生物群落结构的研究来比较不同养殖模式对养殖环境及鱼类健康的影响受到越来越多学者的关注[4,5]。

黄颡鱼Pelteobagrus fulvidraco(Richardson)是典型的底栖杂食性鱼类,是我国重要的水产养殖品种。近年来,我国黄颡鱼养殖产业发展迅速,据《2018年中国渔业统计年鉴》,2017年全国黄颡鱼总产量超过48×107kg,产量位居淡水名优鱼类第三。目前,黄颡鱼养殖模式以黄颡鱼单养、黄颡鱼混养草鱼及黄颡鱼混养草鱼、鳙、鲢三种养殖模式最为常见。草鱼是典型的草食性鱼类,有助于清除池塘杂草;鲢、鳙是典型滤食性鱼类,在控制水体生态环境及水质健康中起重要作用[6,7]。通过比较黄颡鱼不同养殖模式下池塘水体及底泥中微生物的群落结构及差异,有助于掌握不同养殖模式环境微生物群落结构的变化规律,从而有效调整或改进现有养殖模式。高通量测序(HTS)技术由于其快速、准确、数据量大的优点,被广泛应用到动物个体微生物及环境微生物基因组学、功能基因组学的研究中[8,9]。对全面分析样本的微生物群落多样性等意义重大[10]。……