黎作华，张 彬*，余兴龙,周绪斌 (.湖南农业大学 动物科学技术学院，湖南 长沙 408； .湖南农业大学 动物医学院，湖南 长沙 408；.天康生物股份有限公司，新疆 乌鲁木齐 8000)

猪流行性腹泻(porcine epidemic diarrhea,PED)是由猪流行性腹泻病毒(porcine epidemic diarrhea virus,PEDV)引起的一种病毒性疾病。临床上以患病猪呕吐、腹泻、绝食、脱水以及哺乳仔猪的高死亡率为特征[1-2]。该病于1971年首次在英国被发现，1978年分离鉴定出该病毒，并将其命名为PEDV，毒株命名为PEDV CV777株[3]。随后，在中国、日本、韩国和泰国也报告了PEDV感染，美国于2013年首次发现该病毒[4-7]。我国于1976年首次发生该病，但到1984年才确定致病原因[8]。2010年再次暴发PED并持续蔓延，给我国养猪业带来了巨大的损失[9]。

PEDV在分类上属于尼多病毒目、冠状病毒科、冠状病毒属的冠状病毒Ⅰ群成员[10]。该病毒的核酸为线性单股正链RNA，基因组全长为27～33 kb。在所编码的结构蛋白中，S蛋白是PEDV主要的抗原蛋白，在病毒侵入和诱导机体产生中和抗体等方面发挥着重要作用。基于和其他冠状病毒S蛋白的同源性，可以将PEDV的S蛋白分为2段，S1(第1～789位氨基酸)和S2(第790～1 383位氨基酸)[11-13]，S1是变异较大的区域，也是主要功能区域，包含病毒的主要中和表位和受体结合域[14-15]。因此S蛋白一直是新型PEDV疫苗研制的首要目标蛋白。

由于受到宿主免疫选择的压力，S蛋白易发生变异，主要包括碱基的突变、缺失和插入[16-17]。因此对S基因深入和广泛的研究有助于了解PEDV不同毒株之间的遗传进化关系，分析当前流行毒株的特点与变异趋势，为当前PED的防控提供理论依据。

在本研究……