苟继周，李晓星，孙 炎，张鸿英，彭 程，赵 霞，孙宜康，喻 宏，罗伟仁

病理科保存了大量的甲醛固定石蜡包埋(formalin fixed and paraffin embedded, FFPE)组织，这些样本是发现生物分子标志物有价值的潜在资源。病理工作者通过FFPE组织样本获取患者的形态学、遗传学、蛋白质组学和表观遗传学信息，为临床医师提供与精准医学相关的信息[1-2]。然而，在组织处理过程中若未进行标准固定，则无法准确检测突变，因为从FFPE组织中提取的DNA是片段化的，可能含有序列假象，在肿瘤异质性的背景下，序列假象很难与真正的突变区分[3-5]。因此，要掌握甲醛固定过程是渗透、结合和交联三位一体理论，全面了解和认识FFPE标本对下游基因和蛋白分子检测的影响，在临床和科研工作中尽可能做到减少FFPE标本对下游检测的影响[6]。

1 FFPE标本对蛋白质检测的影响

影响蛋白质检测从“热缺血”就已经开始。在手术期间，为控制出血用血管钳夹住血管，组织的血液供应被切断，便发生缺氧、缺血和代谢应激，可能导致蛋白质降解而发生改变。一旦组织离体后，电解质缺乏、细胞代谢产物积累和温度变动等因素会影响生物分子水平的变化，包括潜在的蛋白质生物标志物，因此，冷缺血时间是决定组织是否适用于免疫检测的关键因素[7]。冷缺血对检测的影响还与所检测蛋白质生物特性有关。比如磷酸化位点和磷蛋白水平在5～20 min冷缺血后，就有显著改变[7]；而HER-2在延迟2～3 h后固定，FISH信号和免疫组化染色结果均会减弱。在工作中，发现同一例乳腺癌标本取材的组织块中，其中一块组织取材较大，肿瘤位于组织块中心，周围为大量致密的纤维结缔组织包绕(图1)；……