基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱检测实验动物病原菌效果初探
2020-04-13冯育芳张雪青崔生辉贺争鸣赵德明岳秉飞
中国比较医学杂志 2020年3期
邢 进,刘 娜,冯育芳,张雪青,崔生辉,贺争鸣,赵德明,岳秉飞*
(1.中国食品药品检定研究院 实验动物资源研究所,北京 102629; 2.中国食品药品检定研究院 食品化妆品检定所,北京 100050; 3.中国农业大学动物医学院,北京 100193)
根据我国实验动物微生物检测国家标准,病原菌的检测一直依赖于分离培养和血清学鉴定,不仅需要检测人员具有较丰富的经验,效率和准确性方面都亟待改进。因此分子生物学方法,比如PCR、荧光定量PCR等已逐渐应用到实验动物病原菌检测当中。然而进行病原菌的PCR检测,但是需要对实验室实行严格的分区和污染控制。基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI-TOF MS)依靠激发微生物生成的蛋白质谱与专有数据库进行比较,以实现对微生物的鉴定。其具有操作简单、高效、准确等诸多优势,已经成为微生物鉴定的一种快速而可靠的工具[1]。目前国内外应用MALDI-TOF MS方法鉴定微生物效果的研究已广泛开展,其中与实验动物相关的病原菌主要有金黄色葡萄球菌[2-3]、肺炎链球菌[4]、乙型溶血性链球菌[5]、绿脓杆菌[6]、志贺菌[7]、小肠结肠炎耶尔森氏菌[8]、棒状杆菌[9-10]、巴斯德杆菌[11-12]、皮肤真菌[13]等。然而尚缺乏针对实验动物病原菌整体鉴定效果的研究,本研究采用德国布鲁克公司的Biotyper微生物质谱检测系统对相关菌株进行鉴定,初步评价MALDI-TOF MS方法对实验动物病原菌的检测效果。
1 材料和方法
1.1 实验材料
1.1.1 标准菌株
40株标准菌株,购自美国标准物质保藏中心(ATCC)、中国医学菌种保藏中心(CMCC)和中国兽医微生物菌种保藏管理中心(CVCC)。……
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