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玩游戏,发Nature

2019-11-14徐竞然

润·文摘 2019年10期
关键词:藤蔓蛋白质杂志

徐竞然

刚读研,我就发了篇Nature。要问有什么经验?其实就是打了打游戏。

2019年6月,国际学术顶级期刊《自然》杂志发布了一篇关于蛋白质设计的论文,和各国顶尖科学家一同署名的,还有“Foldit Players”——Foldit游戏的玩家们,我就在其中。

Foldit游戏玩起来并不难。电脑屏幕里,有一团盘根错节的玩意儿,像形状怪异的“藤蔓”。而我要做的就是用鼠标点击、拉动、拖拽、旋转它的枝干与枝叶——太近了往外拉拉,太远了往近靠靠,或者转动下换个角度,玩起来像在线捏3D版橡皮泥。

随着“藤蔓”的结构调整,游戏界面上方的得分栏也在实时变化。得分变高就证明刚摆弄对了,反复尝试着直到达到某个临界分值,界面撒花,顺利通关。

这款游戏由美国华盛顿大学计算机系和生物学系联合开发,好玩、简单,不需要高深的生物学知识,但可用于蛋白质结构预测与设计,服务科学研究与人类未来。

扭曲的“藤蔓”就是人类生命活动的承担者——蛋白质。它“如何扭曲”决定着它将承担具体何种功能,掌握了它的扭曲密码,就掌握了它的工作秘密、它与药物作用的关键,就可能预测出蛋白质结构、人工设计出更好的新蛋白质,来预防或治疗包括艾滋病、癌症、阿尔茨海默症在内的多种疾病。

“藤蔓“扭曲的方式千差万别、极为复杂,且现今无法被科学直接测量出,从原理倒推结构又需要大量的计算,用来处理海量数据的计算机算法还不太会解3D立体几何题……

当我们这些散布于世界各地的玩家们在电脑前轻松自在地玩着游戏时,实际上都在潜移默化地为科学做出贡献:让个人计算机也加入科学家们的科学计算,直接利用人脑天生的三维能力“捏”蛋白质,还顺带着让正“蹲”在电脑里围观游戏直播的人工智能和人类学学空间想象,改善自身算法,早日发挥更大作用。

与Foldit齐名的,还有看起来像俄罗斯方块的游戏EteRNA,让玩家们通过组合色块生成各种结构的RNA。GalaxyZoo(星系动物园)则号召网友们看星星,顺便帮科学家们做做星系数据分类。工作人员最初设想着“哪有人会来玩”,但公众的热情超出预期,网站推出第一天,每小时就有6万份反馈。还有看似画图板的游戏EyeWire可通过玩家力量绘制大脑细胞的神经元网络图,观感像极了扫雷的游戲Phylo被用来排列基因染色体……

2011年,一个曾让科学家们困扰15年之久的艾滋病病毒逆转录蛋白酶结构难题,10天之内被Foldit玩家们利用集体智慧破解,今年玩家们更是在Foldit平台中从零开始设计蛋白质,经测试,玩家设计的146种蛋白,56种都是稳定的。

科研工作者们梦寐以求能踏上一次的《自然》杂志发稿之路,Foldit和玩家们早已驾轻就熟。自2008年5月游戏诞生至今,Foldit共登陆《自然》及其子刊55次,或是被生物学论文引用了游戏成果,或是被杂志“特别介绍”。

游戏是另一个世界,游戏创造秩序,文明在游戏中成长,但游戏也与现实连通。

(张秋伟摘自《中国青年报》)

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