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耐碳青霉烯类鲍曼不动杆菌同源性及生物膜形成能力分析

2019-10-12赵永鑫王晓红郭宇航范学财包名家张晓丽

微生物学杂志 2019年4期
关键词:鲍曼青霉生物膜

赵永鑫 ,王晓红,王 英,郭宇航,范学财,王 勇,包名家,张晓丽*

(1.佳木斯大学 附属第一医院 检验科,黑龙江 佳木斯 154007;2.佳木斯大学 附属第二医院 检验科,黑龙江 佳木斯 154003;3.佳木斯市疾病预防控制中心,黑龙江 佳木斯 154000)

鲍曼不动杆菌(Acinetobacterbaumannii)是医院主要的条件致病菌[1]。由于碳青霉烯类药物的广泛应用,近年来,耐碳青霉烯类鲍曼不动杆菌(Carbapenem ResistantAcinetobacterbaumannii,CRAB)在世界范围蔓延的报道屡见不鲜[2]。细菌生物膜存在于各种物体表面,几乎所有的细菌都具有形成生物膜的能力。鲍曼不动杆菌在48 h内就能够形成成熟的生物膜,其相关感染最常见的就是医疗设备感染[3],特别是医院入侵设备,如机械通气、气管插管等。生物膜的形成在一定程度上促进了菌株在医院环境中的定殖、播散、流行。本研究通过MLST及ERIC-PCR分析佳木斯大学附属第一医院CRAB的分子分型及同源性,通过对比分析CRAB与碳青霉烯类敏感鲍曼不动杆菌(Carbapenem-sensitiveAcinetobacterbaumannii,CSAB)生物膜形成能力,讨论生物膜形成与碳青霉烯类耐药性获得的相关性,为控制其交叉感染和传播提供依据。

1 材料与方法

1.1 材料

1.1.1 菌株来源 收集2013至2014年佳木斯大学附属第一医院临床分离CRAB 35株,剔除重复菌株,采用VITEK II全自动细菌鉴定仪对菌株鉴定并进行体外敏感实验,E-test法测定亚胺培南和美罗培南。筛选菌株于-80 ℃保存备用,根据简单随机抽样原则从CSAB中选取38株作为生物膜形成能力分析的对比菌株。

1.1.2 主要试剂 PCR-MⅨ购自promega corporation USA,结晶紫购自珠海贝索生物有限公司,E-test试纸条购自郑州安图生物股份有限公司,7对管家基因及ERIC引物核苷酸序列由上海生工生物工程有限公司合成。

1.2 方法

1.2.1 MLST 煮沸法制备DNA模板。PCR 扩增7个管家基因https://pubmlst.org/abaumannii/info/primers_Pasteur.shtml,序列见表1。PCR反应条件为 94 ℃ 2 min;94 ℃ 30 s,50 ℃ 30 s,72 ℃ 30 s,35个循环;72 ℃ 5 min。取5 μL PCR产物进行电泳,100 V 50 min,PCR产物送上海生工生物公司测序。序列分析使用Pasteur MLST 将测序后序列输入网站(http://pubmlst.org/abaumannii/)进行序列查询,最终确定ST型。

表1 管家基因引物序列Table 1 Housekeeping gene primer sequences

1.2.2 ERIC 引物ERIC-2 (AAGTAAGTGACTGG-GGTGAGCG),PCR反应条件为94 ℃ 5 min;94 ℃ 45 s,40 ℃ 1 min,65 ℃ 8 min,30个循环;65 ℃ 6 min。

1.2.3 结晶紫染色法生物被膜形成能力定量分析 取单个菌落于4 mL LB肉汤120 r/min 培养18 h;生理盐水配制成0.5麦氏浊度,96孔板加入200 μL肉汤,实验菌液10 μL,4复孔,35 ℃培养24 h;PBS缓冲液冲洗3次;加入1∶10稀释的甲醛200 μL固定15 min;200 μL结晶紫染色15 min;去离子水冲洗,200 μL无水乙醇轻微震荡10 min,570 nm处读取吸光值,重复3次,取均值为该菌株最终D值。生物被膜形成能力定量判读标准[4]:测定阴性对照(LB肉汤)吸光值N,平均N+3S定义为Dc,将待测菌株D值与Dc进行比较:阴性(-):D≤Dc;弱阳性(1+):Dc4Dc。

1.2.4 统计分析 采用SPSS2.0统计软件,Kruskal-Wallis秩和检验比较CRAB与CSAB生物被膜形成能力,组间多重比较采用Bonferroni方法进行校正。P<0.05有统计学意义。

2 结果与分析

2.1 ICU鲍曼不动杆菌检出率

2014至2017年佳木斯大学附属第一医院ICU检出耐鲍曼不动杆菌189株,CRAB的检出率从2014年的92.00%降低至2017年的11.39%(表2)。

表2 2014至2017年ICU患者检出鲍曼不动杆菌及CRAB检出率(%)Table 2 Detection of Acinetobacter baumannii (%)and CRAB (%)in ICU patients in 2014-2017

2.2 药敏实验结果

CRAB除复方新诺明(17.14%)、妥布霉素(2.86%)、左氧氟沙星(36.36%)、头孢哌酮/舒巴坦(91.30%)、替加环素(100%)以外,其余全部耐药,CSAB对14种抗生素的敏感率均大于80.00%,具体见表3。

2.3 耐药基因携带结果

CRAB携带OXA类酶情况,结果如表4所示。部分样本多重PCR电泳结果见图1。

2.4 MLST及ERIC结果

在检测的35株CRAB中,33株ST 2型,是佳木斯大学附属第一医院主要流行克隆型,主要分离于ICU(16/35)和急诊(9/35),分离样本主要是痰液(80.82%)。ST 671型也被发现,在将测序结果拼接比对时,发现1株新型,将其命名为ST 1199型,见表4。ERIC-PCR 结果显示分为A、B、C、D四型,A型9株,B型24株,C型1株,D型1株。部分电泳图结果见图2。

表3 CRAB与CSAB的药敏分析Table 3 Susceptibility analysis of CRAB and CSAB

图1 blaOXA-23、blaOXA-51和blaOXA-24多重PCR电泳图Fig.1 Electrophoretogram of blaOXA-23,blaOXA-51 and blaOXA-24 by multiple PCR M:1 500 bp Marker;OXA-23(73,142);OXA-51(22,73,85,86,142);OXA-24(22)

图2 部分菌株 ERIC-PCR 图谱Fig.2 The partial result of genotyping by using ERIC-PCR method M:Marker(bp);70:A型;111、114、116、118、122、126、131、132:B型;77:C型;125:D型

表4 碳青霉烯类耐药鲍曼不动杆菌的分子特征及耐药基因Table 4 Molecular characteristics and drug resistance genes of carbapenem-resistant Acinetobacter baumannii

注:ERIC为肠道细菌基因重复序列;MLST为多序列位点分型;“+”为存在耐药基因;“-”为不存在耐药基因

2.5 生物被膜检测结果

对73株临床分离的CRAB与CSAB进行生物膜形成能力的定性分析,检测结果见表5,判定标准如前所述。统计分析结果提示佳木斯大学附属第一医院CRAB组总体上生物膜形成能力较CSAB组下降(0.330±0.258、0.534±0.402,Z=2.843,P=0.004),提示碳青霉烯类耐药性的获得可导致生物膜形成能力的下降。

表5 CRAB与CSAB生物膜形成能力定性分布Table 5 Qualitative distribution of CRAB and CSAB biofilm formation capacity

2.6 blaOXA基因携带与生物膜形成能力的相关性

根据OXA酶携带情况,分为3组,1组代表blaOXA-23(-)blaOXA-51(+),2组代表blaOXA-23(+)blaOXA-51(+),3组代表blaOXA-24(+),4组为CSAB对照组,其生物膜形成能力见图3,图中的点是各菌株生物膜吸光度的平均值,每组的均值已经列出。统计分析结果显示CRAB生物膜形成能力与3种耐药基因携带情况均无明显相关性(P=0.369),具体见表6。

表6 blaOXA基因与生物膜形成能力的相关性Table 6 Correlation of blaOXA gene with biofilm formation ability

图3 CRAB与CSAB生物膜形成能力Fig.3 Biofilm formation in the CRAB and CSAB

3 讨 论

鲍曼不动杆菌耐药机制复杂,除了其固有的抗药性外,还可以获得抗药基因,包括产碳青霉烯酶,外膜孔蛋白缺失,青霉素结合位点改变,外排泵的高度表达,生物膜的形成等。碳青霉烯酶是指能够水解至少一种碳青霉烯类抗生素的一类β-内酰胺酶。Ambler分类包括A、B、D类酶。碳青霉烯水解D类β-内酰胺酶(CHDLs),也称为苯唑西林酶(OXA),是在鲍曼不动杆菌临床分离株中发现广泛的β-内酰胺酶。已鉴定出6个群,包括OXA-51-like、OXA-23-like、OXA-40/24-like、OXA-58-like、OXA-143-like和OXA-48-like[5]。佳木斯大学附属第一医院发现的D类酶为blaOXA-23、blaOXA-51、blaOXA-24,其主要的耐药机制是产blaOXA-23[6],这一发现与俄罗斯和中东地区的结果相似[7-8]。有报道称blaOXA-23的携带可以增加CRAB在医院暴发的风险因素[9]。

分子流行病学在监测CRAB的流行及暴发感染方面具有重要的作用。鲍曼不动杆菌临床分离株MLST的种群结构由I、II和Ⅲ的三个国际克隆谱系组成,CC1(ST 1、ST 7、ST 8、ST 19和ST 20),CC2(ST 2、ST 45和ST 47),CC3(ST 3和ST 14),大多数暴发菌属于CC1和CC2[10]。ST 2型是世界上鲍曼分布最广的ST型[11],对于佳木斯大学附属第一医院ST 2型的暴发,与我国安徽地区报道分型一致,意大利也有对于ST 2型院内暴发的报道[12-13],说明本地区与世界流行克隆具有同源性。有研究发现[14],ST 2型与OXA类酶(OXA-23或OXA-24)有关,这与本研究结果一致。从2014年起,佳木斯附属第一医院采取合理措施对可能的影响因素进行控制,例如:医院内空气、地面、机器设备进行彻底消毒处理;医务人员严格执行无菌操作规章制度,取得了初步成效。由此可见,造成ST 2型在医院暴发的最可能影响因素为医务人员的消毒意识不足,其次在ICU中多为免疫力低下的患者,增加了感染概率。

细菌生物膜是指细菌在生长过程中黏附于生物或非生物表面,由细菌自身分泌的胞外多糖基质组成的细菌群体,是水平基因转移的极好环境,可导致耐药基因的获得[15]。苛刻条件下,在生物膜群落内会使耐药基因水平转移并选择出形成能力高的菌株。临床分离的鲍曼不动杆菌几乎都有形成生物膜的能力,其检测主要分为定性法和定量法,本研究采用标准微量滴定板法,通过测量结晶紫的吸光度,定量检测生物膜的含量。抗生素耐药与生物膜形成是CRAB在医院流行的主要原因[16]。生物膜使鲍曼不动杆菌适应恶劣的环境,抑制抗生素对细菌的杀灭作用,使CRAB引起的感染在临床中很难治愈。有研究发现[17],菌毛合成系统、BfmRS双组分调控系统、细菌QS、生物膜相关蛋白(Bap)及外膜蛋白都对鲍曼不动杆菌生物膜的形成有影响。本研究中,CRAB生物膜形成力相对弱于CSAB组,与Babapour等[18]的报道一致,且与blaOXA携带情况无明显相关性。由于佳木斯大学附属第一医院CRAB菌株较少,且主要克隆流行ST 2型,所以无法全面分析各ST分型在生物膜形成能力上的区别。另外,生物膜作为重要的毒力因素,没有对鲍曼不动杆菌的致病力和毒力进行分析,需要进一步研究。

总之,这是佳木斯大学附属第一医院首次对于CRAB流行病学情况进行分析与研究,生物膜的形成与院感密切相关。针对医院ST 2型CRAB的暴发,应该在合理应用治疗药物同时,加强严格消毒的意识,特别是在进行侵入性操作时,应切断交叉感染途径,降低院内感染暴发的风险。

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