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马氏珠母贝DNA甲基化转移酶Dnmt1的克隆及表达

2019-09-25章佳斌卢晓文罗少杰邓岳文

广东海洋大学学报 2019年5期
关键词:分析

章佳斌,卢晓文,罗少杰,焦 钰,邓岳文,2

马氏珠母贝DNA甲基化转移酶的克隆及表达

章佳斌1,卢晓文1,罗少杰1,焦 钰1,邓岳文1,2

(1. 广东海洋大学水产学院,广东 湛江 524088;2. 广东省珍珠养殖与加工工程技术研究中心,广东 湛江,524025)

对马氏珠母贝()DNA甲基化转移酶1(DNA methyltransferase 1,Dnmt1)的基因全长及组织表达作分析,探究马氏珠母贝甲基转移酶Dnmt1()参与贝壳矿化调控机理。利用RACE技术获得的cDNA序列全长,并对的序列特征进行分析,同时利用逆转录-聚合酶链反应RT-PCR技术检测马氏珠母贝不同组织中的表达情况。基因cDNA长4 818 bp,其中,开放阅读框为4 623 bp,编码1 540个氨基酸。预测分子质量约为174.55 ku、理论等电点为5.89。结构域分析显示,PmDnmt1具有DMAP 结合结构域、DNMT1-RFD结构域、锌指结构、BAH结构域和C5胞嘧啶DNA甲基化酶结构域等。多序列比对结果发现,Dnmt1在不同物种间具有较高保守性。实时荧光定量PCR分析显示在所有检测组织中均有表达,在外套膜中央膜部分的表达量最高(< 0.05)。可通过调控外套膜的DNA甲基化修饰参与贝壳的形成。

马氏珠母贝;DNA甲基化转移酶;基因克隆;表达模式

DNA甲基化是目前在表观遗传学中研究最为成熟的一种表观遗传修饰,能够引起DNA稳定性、构象、染色体结构等多方面的改变,在调控基因表达[1]、维持染色体结构[2]以及基因印迹[3]等方面扮演着重要角色。通常来说,DNA甲基化是由甲基转移酶(DNA methyltransferase,Dnmt)起介导作用,并利用腺苷酰--甲硫氨酸(SAM)为甲基供体,将胞嘧啶(C)转变为5-甲基胞嘧啶(5mC)[4]。哺乳动物中,3种DNA甲基转移酶(Dnmt1、Dnmt2和Dnmt3)参与到DNA的甲基化修饰中。Dnmt3分为Dnmt3a和Dnmt3b两种,能够识别半甲基化和未甲基化序列,与DNA序列的从头甲基化有关;……

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