荷斯坦牛DRA基因多态性及序列特征分析
2019-09-21刘丽霞欧阳霞辉乔自林付保强
刘丽霞 张 丽,* 欧阳霞辉 乔自林 付保强
(1 西北民族大学生命科学与工程学院,甘肃 兰州 730030; 2 西北民族大学生物医学研究中心,甘肃 兰州 730030)
牛(Bostaurus)的主要相容性复合体即牛的白细胞抗原(bovine lymphocyte antigen, BoLA)是一组紧密连锁的高度多态基因家族,编码主要组织相容性抗原,与机体的免疫应答和抗病性具有密切的相关性,位于牛的第23号染色体上,由Ⅰ类、Ⅱ类和Ⅲ类基因构成[1-3]。牛DRA基因位于BoLA-Ⅱ类基因的Ⅱa亚区,编码DR分子的α链,参与抗原呈递和传输过程[4],与人DRA基因的结构非常相似[5],牛的DRA基因可在牛晚期黄体的内皮细胞中高表达[6]。与α链上的其他基因相比,DRA基因的多态性较低[7],早期研究认为该基因仅有1个等位基因,是1个单态基因。随后研究者发现牛的DRA基因座位上也存在等位变异,Sigurdardottir等[8]最早报道了5个DRA的RFLP分型;Sena等[9]发现水牛包含2个DRA等位基因,其中1个位于抗原结合位点上,且该基因在不同的品种中具有不同的特征;王兴平[10]在秦川牛、鲁西牛、南阳牛和晋南牛的DRA外显子2的第116和第197位分别发现G→A和T→C的点突变,且该基因对南阳牛的体高标记效应显著;中国荷斯坦牛、中国西门塔尔牛和三河牛中具有3个DRA外显子2的等位基因,其基因型与乳房炎的易感性和抗性有关[11];甘南牦牛和天祝白牦牛DRA外显子2具有3个单核苷酸多态位点(single nucleotide polymorphism sites, SNPs),具有较为保守的多态性[12];而李彥清等[13]在天祝白牦牛、大通牦牛、甘南牦牛和普通牛的DRA第2外显子上检测到197位的T>C和116位的G>A突变;Sun等[14]发现大额牛及其杂交后代DRA基因的核苷酸和氨基酸序列与普通牛和牦牛的相似度达到99%;张周……
