郑珂晖 黎哲镇 叶景山 周富杰 温永仙

摘要：[目的]探索基于自然群体随机交配的单个印迹QTL的定位方法，分析影响定位准确性的关键因素。[方法]若印迹QTL决定的某一性状为数量性状，假设该性状与标记之间的关系存在线性关系，可以采用最小二乘法进行印迹QTL定位和遗传参数的估计。利用计算机模拟单点模拟标记、水稻真实自然群体标记进行印迹QTL定位，比较在不同最小等位基因频率（Minor allele frequency，MAF）、不同遗传率、不同随机交配轮数下的统计功效与参数估计精度，印迹QTL的显著性采用F检验和t检验。[结果]通过模拟研究，证明该试验设计对于检测单个印迹QTL是有效的，在MAF大于5%时，印迹遗传率大于10%时，定位与遗传参数估计趋于无偏。[结论]采用自然群体随机交配产生作图群体，可以用来进行单个印迹QTL的定位，定位的结果较好，是一种有效的试验设计，为下一步进行多个印迹QTL奠定了基础。

关键词：自然群体;关联分析;F检验;印迹QTL;随机交配

中图分类号：Q348文献标志码：A 文章编号：1008-0384（2019）12136407

0 引言

[研究意义]自然群体往往不是严格的遗传群体，如：种质资源、野生种等，它一般不用通过先构建亲本再进行交配产生F2代以后再用自交、回交等方法来产生。相对于结构群体，它的遗传背景一般并不清晰，往往采用关联分析来进行QTL定位。全基因组关联分析”’主要基于基因的连锁不平衡，用以判断表型性状与遗传标记之间的关联性。在全基因组上对逐点扫描遗传标记，依次判断每个标记与相关表型性状的关联水平。……