茶树SRO基因家族的鉴定及表达分析
2019-08-21郭永春王鹏杰陈笛郑玉成陈雪津叶乃兴
郭永春,王鹏杰,陈笛,郑玉成,陈雪津,叶乃兴
茶树基因家族的鉴定及表达分析
郭永春,王鹏杰,陈笛,郑玉成,陈雪津,叶乃兴*
福建农林大学园艺学院/茶学福建省高校重点实验室,福建 福州 350002
(Similar to rcd one)是植物特有的基因家族。本研究利用生物信息学方法从茶树基因组中鉴定获得9个茶树基因家族成员,分别命名为和。9个茶树基因的编码蛋白均具有特征结构域PARP和RST,具有相似的保守基序。系统进化树分析聚分为3组,Ι组包含CsRCD1—4,Ⅱ组包含CsSRO1和CsSRO2,Ⅲ组包含CsSRO3—5。基因结构分析表明每个基因含有4至9个外显子。8个茶树组织转录组数据分析表明,和可能在茶树不同发育阶段具有重要作用;大多数基因在根和成熟叶中较高表达。上游启动子区域分析发现大量与植物发育、激素及胁迫响应密切相关的顺式作用元件,进一步对基因在干旱和脱落酸处理下的表达模式进行分析发现,9个基因均被诱导表达,基因可能与茶树抗旱密切相关。
茶树;;系统进化;干旱胁迫
植物在遭受逆境胁迫时,能够诱导逆境响应基因表达,以在复杂多变的环境生存[1],在这些过程中,通过应激反应参与多条调控网络发挥作用[2-3]。SROs通常包含高度保守的PARP[poly(ADP ribose)polymerase catalytic;PS51059]催化中心和C末端的RST(RCD1-SRO-TAF4;PF12174)保守结构域[4],部分SRO还含有N末端的WWE(PS50918)结构域[5]。
在拟南芥中,家族有6个成员,分别为和[6]。是第一个被鉴定出的拟南芥SRO家族成员[7];可通过与细胞核中的转录因子相互作用,参与植物脱落酸(Abscisic acid,ABA)信号通路介导的干旱响应,还可以通过参与ABA、乙烯(Ethylene,ETH)、茉莉酸甲酯(Methyl Jasmonate,MEJA)等激素信号通路,调控植物发育[8-9]。……
