郭亚茹, 丰继华, 于华峥，牟 锦, 黄月月，刘 珂

(云南民族大学 电气信息工程学院， 昆明 650504)

真核细胞内普遍存在着两种定位性质不同的核小体：即定位良好和定位模糊的核小体。二者的区别在于，定位良好的核小体包装DNA平均长度为147 bp左右，而定位模糊的核小体包装DNA长度不定。尽管随着生物实验技术的进步和成本的下降，不同物种的核小体定位数据在不断产生，但现阶段完全依靠实验方法检测核小体定位性质还面临着以下问题：(1)生物种类繁多，用实验方法检测所有生物的核小体位置是一项不可能完成的任务。(2)生物实验需要大量的人力、物力和时间投入，其成本和时效性是一大制约因素。(3)虽然现阶段实验数据的规模和丰富程度给核小体相关研究提供了极大支持，但仍不能满足部分研究人员希望即时获得自身关注领域数据的现实要求。因此，在基因组研究的某些领域使用计算机建模并进行预测，是对生物实验研究的有力补充，甚至是现阶段一项不可替代的工作。

对于核小体定位性质(定位良好与定位模糊)一般是根据生物实验数据进行研究的。Gan等人[1]于2014年首次从结构角度研究了核小体定位特征和模糊核小体性质，提出了一种基于连续小波变换(CWT)的核小体位置预测新方法(WaveNuc)。

研究表明，基因的转起始位点周围通常存在着一个保守的核小体缺失区域(NFR)[2-4]，而在其上、下游区域的核小体则呈现出周期性排列[5-11]。我们根据现有核……