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甲基转移酶3在前列腺癌中的表达及其临床意义

2019-01-28李显永官润云柯坤彬顾鹏李同海崔庆鹏陈印赵晖

实用医学杂志 2019年1期
关键词:癌基因蛋白肿瘤

李显永 官润云 柯坤彬 顾鹏 李同海 崔庆鹏 陈印 赵晖

昆明医科大学第一附属医院泌尿外科(昆明 650032)

前列腺癌(prostate cancer,PCa)占据全球男性恶性肿瘤发病率第二位[1]。据估计,2018年全美将新增164 690例PCa,占男性新发肿瘤的19%[2]。我国PCa已是70岁以上人群致死率最高的泌尿系肿瘤,且其致死率正逐年上升,严重影响男性健康[3]。因此,对PCa发生、发展及诊治策略的深入研究迫在眉睫。近年研究发现表观遗传学在肿瘤的发生、发展中扮演重要角色。N6⁃甲基腺苷(m6A)是指发生在腺嘌呤第6位氮原子上的甲基化修饰。它是真核生物mRNA中一种高丰度表观转录组学修饰,据报道,人类有近7 600种mRNA以及超过300个非编码RNA存在m6A修饰[4]。最新研究揭示m6A是一种动态可逆的RNA甲基化修饰,由甲基转移酶复合体(METTL3、WTAP、MET⁃TL14),去甲基酶(FTO、ALKBH5),相应的阅读蛋白(YTHDF、YTHDC)等协同调控[5]。METTL3作为催化RNA m6A修饰形成的甲基转移酶复合体成员之一,目前已被证实在肺癌、肝癌和白血病等肿瘤疾病中呈高表达,并发现METTL3促进了肿瘤相关癌基因的翻译,影响肿瘤的发生和进展[6-8]。而MET⁃TL3在PCa中的表达水平及其作用尚不清楚。本实验拟通过TCGA数据集资料分析并运用Westren blot、IHC技术,从mRNA和蛋白水平来研究METTL3在PCa中的表达情况,并探索其临床意义。

1 资料与方法

1.1 一般资料本实验调取2014年4月至2018年1月昆明医科大学第一附属医院病理科PCa蜡块32例和癌旁良性组织蜡块29例,制作为厚度4 μm的连续切片,用于IHC检测。其中年龄59~81岁,平均(66.09±5.49)岁;据2010年AJCC前列腺癌TNM分期标准,T1~T2期21例,T3~T4期11例;N0期27例,N1期5例;Gleason评分 ≤ 7分22例,>7分10例。收集2018年2-4月昆明医科大学第一附属医院行腹腔镜下前列腺癌根治术切除的5例新鲜PCa和配对癌旁良性组织标本,依次编号为T1~T5,N1~N5,标本离体后迅速置入-80℃冰箱保存,用于Westren blot检测。实验前所有标本均由我院病理科HE染色证实为癌或癌旁良性组织;患者术前无长期内分泌治疗及放化疗史;并排除合并其他恶性肿瘤、免疫疾病、代谢疾病以及临床资料不全者。于 TCGA 数据集(https://portal.gdc.cancer.gov/proj⁃ects)下载PCa的mRNA数据和匹配的临床资料,从中纳入各项资料齐全的417例PCa以及52例配对癌旁的数据。本实验经医院伦理委员会审核批准。

1.2 实验材料本实验主要材料包括:DAB免疫组织化学显色试剂盒(BBI);兔抗人METTL3单克隆抗体(Abcam,英国);HRP标记的兔二抗(BBI);PBS(BBI);兔抗beta⁃action多克隆抗体(Abcam,英国);Tween⁃20(BBI);蛋白提取试剂盒(上海生工);BCA试剂盒(上海生工);PVDF膜(广州誉维生物);发光试剂盒(上海生工)。

1.3 方法

1.3.1 免疫组化学方法所有切片依次行二甲苯脱蜡,梯度乙醇水化;柠檬酸三钠抗原修复液,高压锅保压4 min,冷却至室温,后PBS洗3次,各3 min;3%的过氧化氢阻断内源性过氧化物酶,室温孵育15 min,后PBS洗3次,各3 min;6%正常山羊血清,室温封闭30 min;加兔抗人METTL3单克隆抗体(稀释浓度1∶500),4°C湿盒中孵育过夜,后PBS洗3次,各3 min;加HRP标记的山羊抗兔二抗,室温孵育45 min,PBS洗4次,每次3 min;DAB显色,显微镜下观察控制染色时间,蒸馏水终止显色;苏木素复染5 min,1%的盐酸酒精分化,PBST洗返蓝;常规脱水、透明、封片;显微镜采图。使用PBS代替一抗作阴性对照,按抗体说明书选用人膀胱癌组织作阳性对照。

1.3.2 免疫组化结果分析METTL3蛋白以细胞中出现棕黄色染色为阳性表达。所有切片在同一条件下随机选取3个视野采图。图片使用image⁃pro⁃plus 6.0专业图像分析软件(美国Media Cybernetics公司)作免疫组化结果半定量分析[9-10],图片选择腺体区域(排除间质和腺腔部分)测积分光密度(IOD)及面积(area),以平均光密度值(IOD/area,AOD)表示单位面积阳性程度,3个视野的平均AOD值代表METTL3蛋白的表达水平。

1.4 Western blot检测取大约30 mg组织,加200 μL RIPA裂解液,低温高速匀浆10 s,共3次,冰上裂解2 h,高速离心,吸取上清。二奎琳甲酸(BCA)法测定蛋白浓度,最终将浓度调整为5 μg/μL,加入5×的上样缓冲液,沸水浴10 min变性。配制12%的分离胶,5%的浓缩胶。电泳后转至PVDF膜,用5%的BSA⁃TBST封闭。分别与抗METTL3抗体(1∶1 000)和抗 β⁃action(1∶1 000)抗体温室孵育15 min,4℃过夜。加入辣根过氧化物酶(HRP)标记的二抗(1∶5 000),室温 40 min。TBST洗膜5次,各3 min。加入增强型化学发光剂显影3~5 min。曝光,定影,拍照。

1.5 统计学方法使用SPSS 20.0统计软件作数据分析,结果数据以均数±标准差表示。实验数据行正态性检验,组间比较采用配对或独立样本t检验,相关性分析采用Spearman等级相关分析。以P<0.05为差异有统计学意义。

2 结果

2.1 METTL3 mRNA在PCa和癌旁表达的差异TCGA数据集中52例PCa的METTL3 mRNA表达明显高于配对癌旁组织[(7.718±2.151)vs.(5.700± 1.385)],差异具有统计学意义(t=7.257,P<0.01),见图1。

图1 52例PCa和配对癌旁组织METTL3 mRNA表达情况Fig.1 Expression of METTL3 mRNA in 52 cases of prostate cancer and adjacent tissues

2.2 METTL3蛋白在PCa和癌旁表达的差异IHC结果表明PCa和癌旁组织中METTL3蛋白的表达主要定位于细胞核,细胞质中少量表达。METTL3蛋白在PCa组织中表达水平明显高于癌旁良性组织[0.074± 0.055)vs.(0.026±0.018)],其差异有统计学意义(t=4.655,P< 0.01),见图2。Western blot结果显示METTL3蛋白在PCa中表达 量明显高于配对癌旁良性组织,见图3。

图2 METTL3蛋白在不同组织中的表达情况Fig.2 Expression of METTL3 protein in different tissues

图3 5例PCa和配对癌旁组织METTL3蛋白的表达情况Fig.3 Expression of METTL3 protein in 5 cases of prostate cancer and adjacent tissues

2.3 METTL3 mRNA和蛋白在PCa中表达水平与临床病理特征的相关性Spearman等级相关分析发现,METTL3 mRNA表达水平与PCa的Gleason评分呈正相关(r=0.195,P<0.01),而与年龄、T分期和N分期无相关性(P>0.05),见表1;METTL3蛋白表达水平跟PCa的PSA值、Gleason评分呈正相关(r=0.381,P<0.05;r=0.449P<0.01),而与年龄、T分期、N分期无相关性(P>0.05),见表2。

3 讨论

METTL3最早是从Hela细胞裂解液中鉴定出的一个70 kDa的蛋白[11],后续的研究发现其包含结合S-腺苷甲硫氨酸(SAM)和催化m6A形成的两个结构域,具有独立催化RNA的m6A修饰形成的活性[12]。近期研究表明METTL3还可以与MET⁃TL4结合形成异质二聚体[13],WTAP促进其在核斑点的定位,使其催化活性大大提升[14]。m6A是目前发现的100多种RNA转录后修饰中丰度最高的修饰方式[15-16]。m6A修饰在RNA中的定位主要存在Rm6ACH(R=G或A,H=A、C或U)这一共有序列[13],运用高通量测序技术发现m6A峰分布在mRNA 的 3′非翻译区(3′UTR)、5′非编码区(5′UTR),内部外显子、翻译起始和终止密码子附近区域[17-18],鉴于其分布,进一步研究发现m6A可能对mRNA的剪切、3′端的加工、mRNA的出核,翻译效率、mRNA的衰退以及对miRNA的加工发挥重要作用,从而影响多种生物学功能,包括:DNA损伤修复、昼夜节律、组织发育、性别的决定和肿瘤的发生[5,19]。

表1 TCGA PCa数据集METTL3 mRNA的表达与PCa临床病理特征的相关性分析Tab.1 The relationship between the expression of METTL3 mRNA and clinical characteristics of prostate cancer in TCGA PCa dataset±s

表1 TCGA PCa数据集METTL3 mRNA的表达与PCa临床病理特征的相关性分析Tab.1 The relationship between the expression of METTL3 mRNA and clinical characteristics of prostate cancer in TCGA PCa dataset±s

注:**在置信度(双侧)为0.01时,相关性是显著的

P值例数METTL3 mRNA表达水平r值294 123特征年龄≤65岁>65岁Gleason评分≤7≥8 T分期T1~T2 T3~T4 N分期8.486±2.608 8.596±2.269 0.0220.650 228 189 8.056±2.627 9.076±2.244 0.1950.000**143 274 8.331±2.416 8.616±2.557 0.0490.314 0.0570.242 N0 N1 339 78 8.450±2.514 8.815±2.489

表2 METTL3蛋白的表达与PCa临床病理特征的相关性分析Tab.2 The relationship between the expression of METTL3 protein and clinical characteristics in prostate cancer±s

表2 METTL3蛋白的表达与PCa临床病理特征的相关性分析Tab.2 The relationship between the expression of METTL3 protein and clinical characteristics in prostate cancer±s

注:*在置信度(双侧)为0.05时,相关性是显著的;**在置信度(双侧)为0.01时,相关性是显著的。PSA:前列腺特异性抗原。Gleason评分:PCa病理分级使用的评分系统

特征年龄≤65岁>65岁Gleason评分≤7≥8 PSA≤20 ng/mL>20 ng/mL T分期T1~T2 T3~T4 N分期例数METTL3蛋白表达水平AOD值r值P值18 14 0.080±0.045 0.065±0.066-0.1660.363 22 10 0.061±0.043 0.102±0.068 0.3810.031*21 11 0.064±0.048 0.091±0.064 0.4490.010**21 11 0.063±0.051 0.094±0.058 0.2290.096 N0 N1 27 5 0.079±0.057 0.043±0.023-0.2280.209

METTL3在恶性肿瘤中扮演重要角色。本实验发现PCa组织中METTL3的mRNA和蛋白水平均明显高于癌旁良性组织,且METTL3蛋白在前列腺细胞核和细胞质中均有表达。LIN等[17]在肺癌的研究中也发现METTL3表达上调,并在人肺癌细胞的细胞核和胞质裂解液中分别检测到METTL3蛋白的表达,而其他甲基催化酶则只在细胞核中检测到表达,这与本实验结果相符。该研究还运用meRIP⁃Seq技术发现人肺癌细胞系中癌基因EGFR、TAZ、MAPKAPK2(MK2)和DNMT3A的终止密码子附近存在一个或多个m6A峰;敲低METTL3后,相关癌基因mRNA的m6A修饰水平下降,其蛋白水平也明显下降;进一步研究还发现METTL3也可以独立于其他m6A修饰酶招募翻译起始因子eIF3来促进目的基因的翻译。在白血病的研究中也表明,METTL3呈高表达,并促进了c⁃MYC、BCL2和PTEN癌基因的翻译,维持急性髓系白血病的增殖[8]。CAI等[20]在乳腺癌中发现上调 METTL3 可使肿瘤相关蛋白HBXIP的mRNA m6A修饰丰度增加,从而使其蛋白表达增加,促进乳腺癌细胞的增殖和生长,沉默METTL3后有效地抑制乳腺癌细胞的增殖和促进凋亡。然而,在宫颈癌和肾癌中METTL3呈低表达,上调其表达可有效抑制肿瘤进展,表现出肿瘤抑制因子的角色[21-22]。由此可见METTL3在不同肿瘤中发挥着促癌或者抑癌的双重作用,笔者推测METTL3在PCa中发挥促癌的作用,高表达的METTL3可能促进了PCa某些癌基因的翻译,从而影响PCa的发生和发展。

METTL3催化mRNA的m6A修饰形成,影响着多种生物进程。本实验发现,PCa中METTL3 mRNA和蛋白的水平与Gleason评分呈正相关,即METTL3 mRNA和蛋白的表达水平与PCa细胞分化呈负相关关系。VU等[23]在急性髓系白血病中得出相似的结论,高表达的METTL3抑制了骨髓造血干细胞的分化,敲低METTL3后急性髓系白血病细胞周期停滞,有效地促进造血干细胞的分化。METTL3催化的mRNA m6A修饰还可以调节精原细胞的分化,促进精子成熟[24]。LI等[25]研究还发现m6A修饰影响了T细胞在体内的平衡和分化,这也暗示m6A修饰可能参与了肿瘤的免疫调节。此外,在胰腺癌的治疗研究中发现,敲低METTL3后,癌细胞对化疗药物:吉西他滨、5-氟尿嘧啶、顺铂和放疗具有更高的敏感性[26],这也提示METTL3可能是肿瘤治疗的一个新靶点。

PCa的诊疗中,PSA被作为一项有效的临床筛查和风险评估的指标。本实验发现METTL3蛋白的表达水平与PSA值呈正相关关系,结合METTL3与多种肿瘤的相关性,提示METTL3具有与PSA联合作为PCa诊断标记物的潜能。

综上所述,本研究通过对TCGA数据集资料分析并运用Western blot、IHC技术,从mRNA、蛋白水平证明METTL3在PCa中呈高表达,其蛋白表达主要定位在前列腺细胞核,胞质少量表达,METTL3表达水平与Gleason评分和PSA值呈正相关。因而我们推测高表达的METTL3可能调控某些癌基因的翻译,促进PCa的发生、发展,影响PCa细胞的分化,同时可能与PSA联合作为PCa的诊断标记物。本课题组后续将扩大样本量研究,继续探讨METTL3在PCa中的表达及临床意义,并结合分子生物学实验、细胞实验进一步阐述其在PCa可能的机制以及与其他m6A修饰酶的相互关系。

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