胚鼠腭裂形成过程中腭胚组织全基因组DNA甲基化的研究*

2018-09-27舒申友董泽君

中国病理生理杂志 2018年9期

关键词：差异

刘丹，舒申友，李珂，舒璇，董泽君，郎兴

(汕头大学医学院第二附属医院烧伤整形外科，广东汕头 515041)

非综合征型单纯性腭裂(nonsyndromic cleft pa-late only，NSCPO)是一种先天性缺陷病，严重影响人们的健康及生活质量。目前NSCPO的发病机制尚不清晰，已证实基因突变和环境影响都是NSCPO的复杂病因[1-2]。大量研究表明DNA甲基化对维持细胞正常功能、胚胎发育和肿瘤的发生有重要作用，因作用位点较广且调控结果可逆、可遗传等特性而受到关注。Rogers等[3]的研究表明，对妊娠第10天(gestational day 10, GD10)的雌性孕鼠给予高剂量的DNA去甲基化剂5-氮杂-2’-脱氧胞苷时，胚鼠腭裂的频率变高。Bulut等[4]注意到，在GD11和GD14向小鼠施用5-氮杂胞苷(5-氮杂-2’-脱氧胞苷的核苷类似物)时出现多种先天性发育畸形，其中就包括腭裂，提示该化合物的去甲基化作用对早期胚胎发育具有易感性。因此本研究使用高效低成本全基因组DNA甲基化检测技术——甲基化修饰依赖性内切酶测序(methylation-dependent restriction-site associated DNA sequencing,MethylRAD-Seq)法对不同时段的腭裂模型组和正常对照组小鼠腭胚组织进行全基因组DNA甲基化测序，比较基因组不同元件中甲基化位点的差异分布及甲基化水平的差异基因，对甲基化位点的位置信息进行注释，并对差异甲基化位点相关基因和甲基化差异基因进行GO功能富集和KEGG通路富集分析，筛选与胚鼠腭裂形成相关基因及信号通路，为进一步阐明NSCPO的发病机制和进一步实验，提供理论依据。