何高奇， 龚博杰， 陈 诚， 郁明强， 卢兴见,3， 李洪林

(1.华东理工大学 计算机科学与工程系，上海 200237； 2.上海市新药设计重点实验室，上海 200237； 3.上海交通大学 智慧城市协同创新中心，上海 200240)

0 引言

计算机辅助药物设计(computer-aided drug design，CADD)利用计算机快速存取能力和对海量数据的快速分析能力来提高药物设计的效率[1].

药效团虚拟筛选是药物虚拟筛选最流行的方法之一[2].其中基于受体的药效团虚拟筛选方法存在打分函数粗略、忽略蛋白质柔性等缺点[3]，而基于配体的虚拟筛选则优化了打分函数[4].同时，虚拟筛选过程中分子的微观性和复杂性给用户观察分子结构和数据分析带来了很大的挑战.很多CADD软件更多的关注于科学细节而忽略了实用性[5]，所以在软件交互性和信息传达直观性方面存在不足.

因此，笔者将可穿戴式VR技术与微观药物虚拟筛选技术有机结合，基于Unity3D引擎和HTC Vive设备，设计实现了“VR+药效团”的虚拟筛选系统.该系统主要功能包括：虚拟环境中分子和药效团的数据解析与建模；药效团的可视计算过程；虚拟环境下分子和药效团的交互设计.通过构建“VR+药效团”的虚拟筛选系统为药效团的设计分析带来新的视角，增强药物设计者的交互体验[6].

1 相关工作

VR技术与基于配体的药效团虚拟筛选技术[7]的结合涉及3个主要方面的工作：基于配体药效团的虚拟筛选、VR技术应用和交互设备.

基于配体的药效团虚拟筛选技术通过对活性分子的结构和活性数据进行发掘……