胡玲玲，王跃荣，郑海音

（上海中医药大学附属市中医医院检验科，上海 200071）

0 引言

戊型肝炎病毒（hepatitus E virus，HEV）是病毒性戊型肝炎的病原体，以感染青壮年为主，在中国内陆、墨西哥和东南亚地区等均发生过暴发流行，近年来，在发达国家戊型肝炎的流行增多[1]。孕妇患病率较高，且病情严重，容易导致流产、死胎等[2]。

HEV基因组全长约7.5kb，包括5ˊ非编码区、3ˊ非编码区和3个开放阅读框（Openreadingframe,ORF）[3]。ORF1基因长度约为5082bp，编码五种非结构蛋白：甲基转移酶(methyltransferase)、多聚脯氨酸铰链(poly-prolinehinge)、 解 旋 酶 (helicase)、木瓜样半胱氨酸蛋白酶(papain-like protease)和RNA依赖的RNA聚合酶(RNA dependent RNA polymerase)。ORF1不仅与病毒的复制有关，而且还在病毒的培养、病毒适应及致病性等发挥作用。

HEV的不同基因型在致病性方面存在差异，感染后的临床症状和病程结局也有所不同。核酸序列分析表明，目前能感染人类的HEV有4个基因型，分型的依据是全基因序列的核苷酸同源性，因此结果最为准确。但全基因测序历时长耗费大，序列比对也比较困难，我们之前的研究[4]发现ORF1编码的甲基转移酶可作为HEV的分型依据，甲基转移酶是HEV的ORF1所编码的五个非结构蛋白之一，本研究选取ORF1编码的其他的四个非结构蛋白来探讨其是否可以用于HEV的基因分型，报道如下。

1 材料与方法

1.1 HEV参考株

Chi-XJ1株（NC_001434）为基因型4型，是GenBank中测序最全且比较准确的。基因2型只有墨西哥分离株(MEX-14)的全基因序列收录在GenBank中，在此没有列入研究，主要对基因1、3和4型进行探讨。

1.2 多序列比对和系统进化分析

从 NCBI（http://www.ncbi.nlm.nih.gov） 的GenBank中获取了35株HEV病毒株，其基因组是测序完整的且能感染人类，包括12个1型病毒株，9个3型病毒株，14个4型病毒株。……