番茄附生和内生细菌分离与群落相似性分析
2018-08-18王玲玲尚庆茂董春娟
生物技术通报 2018年7期
王玲玲 尚庆茂 董春娟
(中国农业科学院蔬菜花卉研究所 农业部园艺作物生物学与种质创制重点实验室,北京 100081)
植物自身是一个复杂的微生态系统,栖息着大量微生物,其中尤以细菌数量最多,包括定殖于植物根际的根际细菌、附生于植物组织(茎、叶、花及果实等)表面的附生细菌、以及分布于各器官或组织内部的内生细菌[1-2],它们与宿主协同进化,在促进植物生长、抵御病虫害、增强寄主对环境胁迫的抗性方面具有重要作用。植物附生和内生细菌现已作为新型的微生物资源,研究者们在水稻、玉米、番茄、辣椒、白菜等多种作物中分离到具有固氮、促生和生防作用的菌株[3-5]。研究土壤以及植物附生和内生细菌的种类、分布、定殖规律,并比较它们相互间的异同,对筛选植物促生菌具有重要意义。
研究植物附生和内生细菌群落主要采用传统的分离培养方法,依靠形态特征、生理生化特性等进行分类鉴定和计数。但是,可培养细菌仅占自然界细菌总数的1%-10%,传统方法对细菌群落结构及多样性的认识是不全面和有选择性的[6]。近年来,以16S rRNA分析为基础的分子生物学手段的应用为细菌群落结构的解析提供了更高效的研究技术,如末端限制性片段长度多样性(Terminal restriction fragment length polymorphism,T-RFLP)、变性梯度凝 胶 电 泳(Denaturing gel gradient electrophoresis,DGGE)等。这些不依赖于培养的分子生态学方法,通过对条带图谱和序列的分析,更加快速、完整地反映植物附生和内生细菌的群落结构和多样性[7-8]。
本实验以番茄(Solanum lycopersicum cv.)为研……
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