杂交现象在高等生物的进化过程中扮演着重要角色。研究表明由于不完全的地理隔离、生殖隔离，物种形成后仍然会存在不同程度的基因交流，有观点认为大约25%的植物、10%的动物曾经发生过杂交的现象［1］。相对于基因突变而言，杂交能够快速积累遗传变异，有利于增加群体的遗传多样性，促进新物种的形成［2］；其次，杂交有利于生成高度侵入性的基因型［3-4］；最后，因杂交过程而产生的遗传同化作用还可能引起物种灭绝［5-7］。从基因组学出发识别古老和近期的杂交事件，有助于深入理解物种之间的系统发育关系［8］，为研究杂交优势［9-10］提供分子依据，并在培育新品种方面发挥重要的应用价值。

在20个世纪，以Anderson［11］为代表的科学家认为杂交物种的形态特征能够从父母本中遗传继承，从而可以通过形态特征实现对杂交物种的鉴定；随着研究的深入，人们发现当杂交个体缺乏中间形态或父母本形态特征时，将导致有效的形态特征过少［12］，并且由于形态特征易受环境因素的影响，导致鉴定杂交物种的准确度很低，因此该方法逐步淡出了人们的视野。

鉴于形态学特征不能很好的鉴定杂交物种，人们开始寻找新的遗传标记，如利用次级代谢物进行杂交物种的鉴定提供了较为可靠的证据。比较成熟的标记物主要包括酚类、萜类、生物碱、异硫氰酸酯和黄酮类化合物，其中黄酮类化合物使用的频率最高［12］。1951 年，Zobel［13］首次将次级代谢产物标记用于杂交物种的识别；……