APP下载

如何利用BioLINCC申请临床研究数据和生物样本

2018-08-18贺海蓉田国祥高凡杨津曾宪涛吕军

中国循证心血管医学杂志 2018年7期
关键词:研究者页面样本

贺海蓉,田国祥,高凡,杨津,3,曾宪涛,吕军,3

Biologic Specimen and Data Repositories Information Coordinating Center(BioLINCC,生物样本和数据存储库信息协调中心)。BioLINCC由美国国家心脏,肺和血液研究所(NHLBI)于2008年建立。该研究所在心脏,肺部和血液疾病的预防和治疗方面提供全球领导地位,并支持这些领域的基础,转化和临床研究。NHLBI通过建立BioLINCC,为广大医学研究人员提供访问科研数据和接触生物样本的便捷渠道,最大限度地提高NHLBI开发和维护的研究资源的利用率。这些资源是自1975年以来由血液疾病资源部门管理的NHLBI生物样本库和自2000年以来由心血管科学研究中心管理的NHLBI数据库[1-3]。

BioLINCC公共网站(https://biolincc.nhlbi.nih.gov/)于2009年10月成立,该网站提供了NHLBI收集的来自110余家研究机构产生的临床、流行病学研究数据和生物样本。BioLINCC一致积极致力于数据共享,受到众多医学科技工作者的厚爱,每年都有百余位研究项目负责人向BioLINCC申请使用其数据进行临床研究。一项来自2015年耶鲁大学医学院附属医院的研究表明,超过90%的用户对BioLINCC分享给他们的数据表示满意,适合利用这些数据开展他们的临床研究。有半数用户已经利用数据完成其研究,并且其中67%的用户已经发表文章,文章数量超过1000篇[4]。本文将介绍如何利用BioLINCC申请数据和生物样本。

1 注册BioLINCC账号

研究者在申请访问BioLINCC数据或者生物样本前,需要在BioLINCC官网进行账号注册。登录BioLINCC官网,点击首页右上角“Register”(图1),网站跳转到注册账号的页面(图2)。注册信息中带星号为必填项,包括研究者姓名、所在研究机构、电子邮件、电话号码、用户名和密码。通讯地址、传真号码、所在城市、国家为选填项目。当研究者将注册信息完成后会收到确认邮件,点击邮件中的链接完成确认,账号即注册完成。

2 检索研究资源

在BioLINCC网站首页“Search for Study Datasets and/or Biospecimens”下方可输入关键词搜索研究项目,数据或生物样本的具体信息将在搜索的研究项目当中显示。在关键词下方有四个高级搜索选项,可以对搜索内容更加具体化。包括:研究共享资源类型(数据或者生物样本),研究涉及的生物材料、研究涉及的疾病及研究类型。在四个选项当中的下拉菜单可勾选与研究者搜索目标符合的子类别,再点击“Search”。我们以搜索与心肌梗死相关共享研究数据为例,展示如何通过BioLINCC检索目标信息。在关键词一栏输入“Myocardial Infarction”,在“Common Properties”选项下勾选“Has Study Datasets”,点击“Search”(图3)。搜索结果如图4,符合本次搜索条件的共183项研究,其中首页显示35项。点击“Show All”即可显示所有搜索结果。点击研究列表的第一项研究“Action to Control Cardiovascular Risk in Diabetes (ACCORD)”可进入该目标研究的主页面(图5)。这是一项控制糖尿病患者心血管疾病发病风险的研究(ACCORD)。该页面显示的内容包括研究类型、研究时间、研究项目的官网、项目注册的链接、已发表文章链接、该研究共享数据和生物样本使用须知、研究方案摘要等具体信息。若想进一步了解该研究涉及哪些数据或样本,可点击“Additional Details”中的“Study Population”和“Available Biospecimens”,会对研究人群和生物样本有一些基本的描述。

图1 BioLINCC网站首页

图2 账号注册页面

图3 检索目标研究页面

图4 搜索结果

图5 目标研究页面

这种以关键词搜索的方式指的是在每项研究相关的文本字段中出现的关键词,文本字段包括研究周期、目的、背景、主题、设计和结论。若研究者无法通过关键词搜索方式找到需要的数据或标本,或希望在多项研究中搜索信息,可向BioLINCC提交申请资源的请求,等待其为研究者寻找合适的资源[5]。

3 申请数据和生物样本

BioLINCC数据库存储的数据和生物样本均免费提供,但运送生物样本的邮寄费用需研究者承担。研究者需向BioLINCC提交申请,审核通后,才会向研究者开放其申请使用的数据或生物样本。当研究者找到欲获取其数据或标本的研究项目时,如图5所示,在页面最下方或右上角,点击“Request Specimens and/or Data”后,登陆账户继续完成申请。账户登陆成功后,选择需要申请的资源类型:数据/生物样本/数据和生物样本。根据申请的资源类型不同,填写的申请表格和提供的申请材料也不同(表1)。

表1 BioLINCC申请数据和生物样本需提交的材料

仅申请使用数据的流程相对简单(图6),需填写内容包括四大板块:申请人基本信息,申请人研究经费及其所在研究机构信息、本次研究方案具体信息、上传申请材料。其中研究资源分发协议(RMDA)是申请方与NHLBI就共享研究资源达成的协议,可以在BioLINCC官网“Procedures and Forms->Agreement Templates”页面下载,打印该协议,由研究负责人和研究机构代表人签名并扫描,上传扫描件[5]。

图7展示了仅申请生物样本时的申请表格内容,在“Request Detail”部分与申请数据时有所不同,需填写申请生物样本的数量、生物样本类型、生物样本的数量(附上单位)、需检测的参数、试验类型、生物样本量的计算依据[5]。

完成所有信息填写后,点击“Submit”,如信息填写未完成,可点击“Save for Later”,保存已填写信息,下次登录后继续完成。对于一项未完成的申请如超过三个月没有任何更新将会自动关闭,申请人可登录BioLINCC重新打开该申请。

图6 仅使用数据时的在线申请表格

图7 仅使用生物样本时的在线申请表格

4 申请完成的后续工作

研究者提交数据或生物样本的申请后,NHLBI工作人员将对申请材料进行审核。对于申请数据资源,NHLBI主要审核所申请数据与研究方案是否相匹配,以及伦理委员会对该研究方案出具的说明(伦理审核通过或豁免)。申请生物标本时,NHLBI审核包括伦理问题、资金和设备是否充足、研究方法的科学性、研究人员的研究资质[5]。

对已获得研究资源的申请人,BioLINCC会在每年3月1号向其发送邮件提醒提交研究进展报告,研究者也可在申请成功后的任何时间在其申请页面提交进展报告。进展报告提交的内容涉及该研究项目的总体进展情况、与之相关的发表论文或在投论文或论文摘要、已完成的研究是否遵守RMDA。已发表的文章将在该资源所在的研究项目网页上显示[5]。

申请数据时签订的RMDA协议有效期为3年,当协议即将到期时,BioLINCC工作人员会向申请方发送提醒,并提供续签协议或销毁数据的说明。如研究项目已完成或RMDA协议已过期且不打算续签,申请方必须通知BioLINCC,在个人电脑、便携式媒体或机构服务器上的所有数据已被永久删除,任何数据CD已被销毁。如研究项目负责人变更其研究工作单位,须提交全新的数据申请,将Biolincc共享的数据转移至新的研究机构时,需确认之前的研究机构中剩余的数据均已被销毁,或移交给另一个负责人。仅申请生物样本时签订的RMDA不会过期,不需要续签[5,6]。

5 总结

BioLINCC是优质医学研究数据和生物样本的收藏者,是先进医学研究理念和研究方法的传播者,是积极促进全球医学数据共享的践行者。通过利用BioLINCC的研究资源,有越来越多的研究成果不断产生。BioLINCC的缺点在于:BioLINCC每项研究共享资源均需独立分开申请,对于欲申请多项研究资源的申请者来说,申请过程复杂;在BioLINCC搜索生物样本时需提供生物样本名称,对于研究目的还未明确的研究者来说,该搜索方式不够高效。未来BioLINCC还会扩大数据共享的领域,提供更加便捷的资源申请流程,以“高效益-低成本”的方式收藏和维护数据和标本,最大限度提高已有资源的利用度[1,2,4]。

猜你喜欢

研究者页面样本
刷新生活的页面
答案
用样本估计总体复习点拨
让Word同时拥有横向页和纵向页
用水痘病毒开发新型HIV疫苗
研究者称,经CRISPR技术编辑过的双胞胎已出生。科学将如何回应?
规划·样本
研究者调查数据统计
随机微分方程的样本Lyapunov二次型估计
年轻瘦人糖尿病增多