血细胞样本长期低温保存对DNA质量和产量的影响
2018-06-27窦为娟卢颖辉周敏林曾彩虹刘志红郑春霞
肾脏病与透析肾移植杂志 2018年3期
窦为娟 卢颖辉 唐 蓉 周敏林 贺 贝 尹 茹 朱 萍 曾彩虹 刘志红 郑春霞
生物样本库为医学研究提供了重要资源,高质量的冷冻样本是进行基因组学、转录组学、蛋白组学等研究的最基本要求。疾病的复杂病因学是一个挑战,遗传易感性、生活方式及环境都可能对疾病的发展有影响。随着医学水平的发展,一些新基因逐渐被发现,以及一些已知基因新功能的确定,需要重新对某类患者进行大规模基因组学研究,因此要收集成千上万份的血液或组织样本,这些样本可能于生物样本库中已经保存了很多年[1-2]。从临床诊断到基因组学研究,血液样本是最常用的提取DNA材料之一,能否从血液样本中提取到高质量的DNA是限制后续基因组学研究成功的关键。样本的质量直接影响后续研究的准确性和科学性[3-5]。
血液样本中DNA通常以全血、血细胞、白膜层、血单个核细胞、血凝块这五种形式保存,关于不同形式之间保存效果比较的报道较少见。有研究指出DNA的保存形式应根据研究需要来选择[6-7],然而在实际操作中,还需要考虑到样本采集量是否节约,收集是否便利快捷,样本能否被充分利用,以及保存空间和成本等因素。10年前我们样本库采用抗凝血分离出血细胞的形式保存DNA,并将吸取的上层血浆同时进行冻存,这种保存方法使得血液样本充分利用,并减少患者采血量和中间人为操作环节。本研究通过检测保存10年以上血细胞样本抽提DNA的纯度、产量及完整性,明确长期低温保存的血细胞样本DNA能否用于后续全基因组关联分析(GWAS)、外显子测序等基因组学研究。……
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