ARMS法与测序法检测127例非小细胞肺癌组织EGFR基因突变的结果对比分析
2018-06-211重庆医科大学附属第二医院检验科重庆4000002第三军医大学大坪医院病理科重庆400042
(1重庆医科大学附属第二医院检验科 重庆 400000)(2第三军医大学大坪医院病理科 重庆 400042)
EGFR基因位于第七号染色体短臂上(7p12),长约118 kb,由28个外显子组成。其编码的蛋白具有酪氨酸激酶(tyrosine kinase,TK)活性,是NSCLC最常见的驱动基因,据统计,中国NSCLC患者中EGFR突变率约为35%~40%[1]。EGFR诱导癌症至少通过3种机制:EGFR配体的过表达、EGFR的扩增或EGFR的突变活化,其中以EGFR 的突变活化为主要机制。已经检测到的突变数量最多的是非小细胞肺癌[2-3]。测序法是传统广泛应用的方法,在检测EGFR突变中使用较多,但由于其灵敏度有限、检测过程时间长,对技术设备条件要求严格等,在临床应用受到一定限制。而ARMS法由于其灵敏度较高、耗时少、易操作等特点,在各种标本类型中甚至在外周血循环肿瘤细胞DNA中检测EGFR突变也有一定的意义。因此本文通过ARMS法和直接测序法两种检测的对比,来选择更加敏感,准确的EGFR基因检测方法。
1.资料与方法
1.1 标本来源
对2012年7月—2013年11月在第三军医大学附属大坪医院病理科接受EGFR突变检测的NSCLC病人标本进行研究,其中非小细胞肺癌的患者127例,其中:男性76例、女性51例、年龄26~83岁,平均年龄54.5岁。
1.2 仪器与试剂
ARMS试剂盒内含内参基因特异性引物,探针,EGFR基因突变型,内控基因特异性引物,dNTP的溶液,TaqDNA聚合酶,阳性质控品,PCR管,荧光PCR管。
1.3 检测步骤
待测样本进行DNA提取后,使用微量紫外分光光度计(NanoDrop1000)测定DNA浓度及纯度,取10ulDNA样本稀释至100ng∕ul待用。将纯化后的DNA用荧光PCR方法进行检测,得到突变基因的反应曲线。测序法则上测序仪进行检测,结果与EGFR序列进行比对。……
