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CRISPR/Cas9技术在表观基因组中应用的探讨

2018-06-07贺帅王淑辉孙秀柱

生物技术通报 2018年5期

贺帅 王淑辉 孙秀柱

(西北农林科技大学动物科技学院,杨凌 712100)

对生物体基因进行改造是提高动植物遗传育种效率的有效方式。在基因改造的研究进程中,科研工作者对生物体中基因的修饰和改造研究不断开拓。1989年,Thomas等[1]利用同源重组(Homologous recombination,HR)技术实现小鼠的基因打靶;Urnov等[2]于2005年使用锌指核酶(zinc-finger nucleases,ZFNs)技术对T细胞基因组基因编辑;Nakajima等[3]于2010年使用转录激活样效应因子核酸酶(Transcription activator- like effector nucleases,TALENs)技术靶向切割双链DNA;2012年,随着成簇规律间隔短回文重复序列/成簇规律间隔短回文重复序列关联蛋白9(Clustered regularly interspaced short palindromic repeats/CRISPR-associated proteins,CRISPR/Cas9)的发现至今,逐渐成为基因编辑研究中最为普遍的工具[4]。相比于HR,ZFN和TALEN技术基本实现基因的定点编辑,但是,这两种基因编辑技术需要组装识别切割区域DNA的结合蛋白体,相比于通过小向导RNA(Small guide RNA,sgRNA)与DNA碱基互补配对确定编辑靶向关系的CRISPR/Cas9核酸酶系统,难度和门槛要高得多[5]。

CRISPR/Cas9技术利用一段长度为20 nt左右的sgRNA引导Cas9核酸酶对目标DNA进行切割,引起DNA的修复进而改变目标DNA基序。碱基序列的排布是DNA信息含量丰富度的主要因素,然而基因组的表观修饰也提升了DNA的信息含量。包括被称为第5种碱基的5甲基胞嘧啶(5mC),被称为第6种碱基的5羟甲基胞嘧啶(5hmC),以及5甲酰胞嘧啶(5fC)和5羧基胞嘧啶(5caC)被更多地研究,为探索DNA的结构和功能提供有效的理论基础[6]。H3、H4组蛋白修饰通过调节染色质结构参与到基因的表达调控[7]。跨越过去20年的大量研究证据呈现了丰富的表观遗传机制,包括发现DNA修饰,组蛋白翻译后修饰(PTM)和非编码RNA(ncRNA)与表型相关的大量结果[8-10]。……

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