精子顶体相关基因SPACA7的转录活性研究
2018-05-09张菁华周永翠唐爱发
张菁华,周永翠,唐爱发*
(1.中山大学中山医学院,广州 510275;2.深圳市第二人民医院转化医学研究院,深圳 518037)
本实验室前期研究中,采用Affymetrix公司的小鼠全基因组表达谱芯片筛选出一批睾丸特异性表达新基因,其中一个睾丸特异性基因是SPACA7(原命名为T279),小鼠不同组织、器官、细胞系的高通量基因表达模式显示,SPACA7仅在睾丸组织中特异表达[1]。SPACA7属于精子顶体结合蛋白家族成员,该蛋白家族成员只有SPACA3和SPACA5具有较高的氨基酸同源性,其它成员同源性不高。有报道表明,在小鼠雄性生殖细胞发生过程中有超过50%的基因组基因发生表达,但是仅仅只有4%的基因组基因发生转录。基因转录调控对于该基因的时空表达以及表达强度等至关重要,本文旨在通过分析SPACA7 16对启动子的转录活性,筛选SPACA7的有效启动子,为日后研究SPACA7的基因转录调控做基础。
资料与方法
一、研究对象及试剂
1.研究对象:人肾上皮细胞293T(购自美国模式培养物集存库ATCC,CRL-3216)。
2.主要试剂:pGL3-basic、Renilla质粒和Dual-Luciferase Reporter Assay System购自美国Promega公司;逆转录试剂盒、高保真DNA聚合酶primer STAR、DNA聚合酶ExTaq以及相关PCR试剂购自日本TakaRa公司;RNA提取试剂盒、DNA提取试剂盒、凝胶回收试剂盒和质粒小量提取试剂盒购自美国QIAGEN公司;限制性内切酶XhoⅠ、HindⅢ 和T4DNA连接酶购自美国New England Biolabs公司;无内毒素质粒大量抽提试剂盒和Lipofectamine 2000脂质体转染试剂购自美国Invitrogen公司;胎牛血清及培养基购自美国Gibco公司。
3.主要仪器:PCR仪(ABI Veriti,美国)、凝胶成像系统(Bio-Rad GelDoc,美国)、酶标仪(THERMO FISHER Multiskan FC,美国)。
二、实验方法
1.SPACA7基因启动子序列获取及引物设计和合成:使用Promoter 2.0和Neural Network Promoter Prediction对SPACA7基因启动子进行分析,在NCBI的GeneBank中查找,获取人类SPACA7基因转录起始位点上游2000 bp与下游84 bp序列。……
