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犬链球菌M蛋白基因的克隆及生物信息学分析

2018-04-13梁昱刘燕霏孙晓莉杨建德

天津农学院学报 2018年1期
关键词:结构分析

梁昱,刘燕霏,孙晓莉,杨建德



犬链球菌M蛋白基因的克隆及生物信息学分析

梁昱,刘燕霏,孙晓莉,杨建德通信作者

(天津农学院 动物科学与动物医学学院,天津 300384)

本研究对犬链球菌M蛋白(SCM)基因克隆,并对其进行生物信息学分析,预测其蛋白质结构及功能,为链球菌表位疫苗的研究及链球菌病的诊断提供参考。利用ExPASy ProtParam在线分析软件,预测犬链球菌M蛋白为亲水性蛋白质且属于稳定蛋白。使用SignalP 4.1软件推测该蛋白有信号肽。利用SOPMA中5种相互独立的方法预测其二级结构,其中α螺旋占83.53%,可知α螺旋为二级结构的主要元件。应用SWISS-MODEL在线分析软件,进行三级构造同源建模,发现其结果与二级结构预测结论大致相同。使用DNAStar预测软件中的Protean 部分对SCM亲水性、蛋白质的二级结构、抗原性指数、表面可能性、柔韧性进行归纳比较分析,在第55~59和第377~379氨基酸区段存在B细胞表位。

犬链球菌M蛋白;生物信息学分析;蛋白质结构;B细胞表位

犬链球菌(,SC)属于一类G群链球菌,对动物有较强的致病性。常常引起猫和犬败血症和关节炎,偶尔引起奶牛乳房炎;也可感染人出现脑膜炎等症。近年来,链球菌感染及相关毒力因子研究逐渐得到人们的关注[1]。M蛋白是A群链球菌主要的毒性抗原决定簇,并且能够作为其逃生的一种手段来躲避动物体内的免疫防御机制。M蛋白作为链球菌细胞壁外的一种构造,犹如网球表面的绒毛,可以帮助链球菌逃避吞噬作用并在宿主中存活下来。M蛋白具有很好的抗原性,能够使机体产生特异性抗体,还可以激活细胞使其增殖并释放出淋巴因子,使机体产生免疫保护作用[2]。……

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