猪流行性腹泻病毒流行株M基因的克隆与序列分析
2018-03-07丁卫星王荣谈李春华郭佳宏倪建平缪德年
丁卫星,王荣谈,李春华,,夏 叶,郭佳宏,倪建平,缪德年,*,赵 敏*
(1上海瑞丰农业科技有限公司,上海201106;2上海市农业科学院上海种猪工程技术研究中心,上海201106;3上海市农业科学院畜牧兽医研究所,上海201106;4上海佳牧生物制品有限公司,上海201106)
猪流行性腹泻是一种由猪流行性腹泻病毒(Porcine epidemic diarrhea virus,PEDV)引起的,以严重的肠炎、腹泻、呕吐、脱水和仔猪高死亡率为显著特征的猪急性高度接触性肠道传染病[1]。自2010年底中国猪流行性腹泻疫情暴发以来,该病持续在中国流行蔓延,给养猪生产带来了巨大的经济损失,直至2015年中国部分地区的猪场仍然发病严重[2-4]。PEDV基因组全长为28 033 nt,编码4种主要结构蛋白[纤突蛋白(Spike protein,S)、小包膜蛋白(Envelope,E)、膜糖蛋白(Membrane,M)、核衣壳蛋白(Nucleocapsid,N)]和4种非结构蛋白(1a、1b、3a、3b)。其中M蛋白(27—32 kD)在病毒囊膜蛋白中含量最多,并通过与S蛋白和N蛋白互作参与病毒的组装。M蛋白具有跨膜结构,短的N末端结构域位于病毒外,C端结构域在病毒内[1]。在补体存在的条件下,M蛋白可诱导机体产生中和抗体,而且M蛋白还可以诱导α干扰素的产生[5]。本研究克隆了发病猪群临床分离株PEDV D1和D3的M基因序列,并分析目前我国PEDV流行毒株M蛋白的抗原性,以期为PEDV疫情诊断方法的建立和防控提供依据。
1 材料与方法
1.1 材料
PEDV临床毒株D1和D3分离自具有腹泻临床症状的仔猪。大肠杆菌JM109感受态细胞、pMD18-T载体、RNA提取试剂盒、高保真Prime STAR HSDNA聚合酶、DNA琼脂糖凝胶回收试剂盒、DL 2000 DNA Marker、质粒小量提取试剂盒均为宝生物工程(大连)有限公司产品。
1.2 引物
从GenBank中下载近年来流行的PEDV M基因核苷酸序列,经比对后根据其保守序列设计1对引物,用于 M基因的扩增。……
