基于Python的自动获取生物信息数据的软件设计 *
2018-01-08周斯涵刘月兰
哈尔滨师范大学自然科学学报 2017年4期
周斯涵,刘月兰
(哈尔滨师范大学)
基于Python的自动获取生物信息数据的软件设计*
周斯涵,刘月兰**
(哈尔滨师范大学)
从国际生物信息学数据库中采集数据来进行相关领域的分析,但随着数据库规模不断扩大,数据来源种类繁多,即便是直接从网页中搜索所需的数据,仍十分繁琐并且消耗了大量的时间.为了解决该类问题,基于Python开发出了一款可自动从云端数据库中获取指定的数据的应用软件,有效地解决了在巨量生物信息数据中如何准确检索与快速获取的难题.
数据库;生物信息;数据获取;软件设计
0 引言
自从美国启动人类基因组计划以来,各种生物的基因组的测序工作进展十分迅速.目前,在美国GenBank数据库中的DNA序列的数量已经超过70亿碱基对.足可预见,未来的生物信息数据的增长将更为迅速.在人类基因组计划进入后基因组时代后,生命科学的研究面临着严峻的挑战.生物信息学是互联网不断发展以及各种生物实验数据快速增长的形势下不断发展起来的采集生物学数据,并从生物学数据中获取新知识的一门学科,为了使生物信息学研究者不在浩如烟海的信息中迷失方向,该文基于Python开发出一款可自动从各大数据库中获取指定条目数据的应用软件,有效地解决了在巨量生物信息数据中如何准确检索与快速获取的难题.
1 生物信息数据库
1.1 数据库背景
目前有许多类别的生物信息学数据库供相关领域的……
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