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代表性鱼类物种全基因组测序研究进展

2017-12-19陈泓宇陈艳艳陈善元

生物学杂志 2017年6期
关键词:物种研究

陈泓宇, 陈艳艳, 李 蓉, 肖 蘅, 陈善元

(云南大学 生命科学学院, 昆明 650091)

代表性鱼类物种全基因组测序研究进展

陈泓宇, 陈艳艳, 李 蓉, 肖 蘅, 陈善元

(云南大学 生命科学学院, 昆明 650091)

鱼类不仅是脊椎动物中种类最多的一个类群,还是研究脊椎动物演化过程的重要环节之一。基于已完成全基因组测序的鱼类代表性物种信息,从鱼类的基因组倍增、重要基因的演化、免疫系统的演化等3个主要方面进行了概述,以期了解脊椎动物从原始无颌类到软骨鱼类再到硬骨鱼类演化过程中发生的基因组或基因变化,为今后鱼类进化基因组学研究提供一定的参考。

鱼类;全基因组测序;脊椎动物演化

基因组学(Genomics)在1986年首次被提出后,Venter等于1995年率先报道了第一个微生物(Haemophilusinfluenza)基因组序列,为生命科学研究打开了新的大门。相比传统的单基因研究,基因组学催生了生命科学的大数据时代。基因组学极大的数据量使得测序的核苷酸序列剧增,提供了丰富全面的DNA信息,对生物系统发育和抗病力等方面研究的发展产生了极大地推动作用[1]。随着测序技术日渐成熟,在测序费用越来越低,二三代测序技术精度越来越高地推动下[2],各生物的全基因组测序也越来越普遍。全基因测序使得生物学在分子层面的研究更加深入,为探讨物种间和种内群体间的遗传多样性、自然选择及物种形成等方面都带来了便捷[3]。

鱼类是脊椎动物中最为繁盛的一个类群,截至2016年就有超过36 000个物种被描述,主要包括软骨鱼类和硬骨鱼类。……

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