基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱在临床微生物检验中的应用与发展
2017-12-02张嵘
张 嵘
基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱在临床微生物检验中的应用与发展
张 嵘
基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱; 微生物鉴定; 细菌耐药性; 分子流行病学
Application and development of MALDI-TOF MS in clinical microbiology laboratory
基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI-TOF MS)自20世纪90年代开始成功用于细菌的快速鉴定,其原理是根据不同细菌的特征性蛋白指纹图谱进行细菌鉴定,打破了传统生化反应方法烦琐的鉴定流程,大大缩短了检测时间,降低了检测成本,且具有准确、高通量等优势,为临床微生物检验带来了革命性的发展。MALDI-TOF MS在临床微生物实验室的应用主要涵盖以下方面:①病原微生物的鉴定;②细菌耐药性的检测;③某些特定菌株的分子流行病学分析。
1 MALDI-TOF MS在病原菌鉴定中的应用
1.1 培养后病原微生物鉴定
MALDI-TOF MS对培养后临床病原菌的快速检测已十分成熟,有文献评估临床常用的2台质谱仪——布鲁克公司Biotyper MS和物生梅里埃公司的VITEK MS的鉴定性能,其对临床常见病原菌的鉴定准确率均达95%以上[1]。此外,MALDI-TOF MS在厌氧菌、真菌、分枝杆菌及其他少见或难培养细菌的鉴定方面与传统方法相比较具有明显优势。
采用传统方法鉴定厌氧菌周期长,鉴定困难,有些菌种之间很难区分,不能满足临床实验室快速准确的要求。随着MALDI-TOF MS数据库不断完善,MALDI-TOF MS对临床分离的厌氧菌鉴定准确率已经达到90%以上[2]。与“金标准”16S rRNA相比,197株临床分离厌氧菌,MALDI-TOF MS鉴定准确率为94.9%[3]。真菌亦是临床鉴定的难题,质谱对临床常见白念珠菌、近平滑念珠菌、热带念珠菌、新生隐球菌等鉴定总准确率能达96%以上,但是对数据库中未包含的菌种,例如弗比恩毕赤酵母无法给出鉴定结果,需要自建库进行补充[4]。……
